Protein–RNA interactions for Protein: Q8C7I4

Apol9b, Apolipoprotein L 9b, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol9bQ8C7I4 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Apol9bQ8C7I4 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Apol9bQ8C7I4 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Apol9bQ8C7I4 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Apol9bQ8C7I4 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Apol9bQ8C7I4 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Apol9bQ8C7I4 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Apol9bQ8C7I4 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Apol9bQ8C7I4 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Apol9bQ8C7I4 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Apol9bQ8C7I4 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Apol9bQ8C7I4 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Apol9bQ8C7I4 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Apol9bQ8C7I4 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Apol9bQ8C7I4 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Apol9bQ8C7I4 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Apol9bQ8C7I4 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Apol9bQ8C7I4 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Apol9bQ8C7I4 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Apol9bQ8C7I4 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Apol9bQ8C7I4 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Apol9bQ8C7I4 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Apol9bQ8C7I4 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Apol9bQ8C7I4 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Apol9bQ8C7I4 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Apol9bQ8C7I4 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Apol9bQ8C7I4 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Apol9bQ8C7I4 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Apol9bQ8C7I4 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Apol9bQ8C7I4 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Apol9bQ8C7I4 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Apol9bQ8C7I4 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Apol9bQ8C7I4 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Apol9bQ8C7I4 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Apol9bQ8C7I4 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Apol9bQ8C7I4 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Apol9bQ8C7I4 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Apol9bQ8C7I4 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Apol9bQ8C7I4 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Apol9bQ8C7I4 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Apol9bQ8C7I4 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Apol9bQ8C7I4 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Apol9bQ8C7I4 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Apol9bQ8C7I4 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Apol9bQ8C7I4 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Apol9bQ8C7I4 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Apol9bQ8C7I4 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Apol9bQ8C7I4 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Apol9bQ8C7I4 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Apol9bQ8C7I4 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Apol9bQ8C7I4 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Apol9bQ8C7I4 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Apol9bQ8C7I4 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Apol9bQ8C7I4 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Apol9bQ8C7I4 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Apol9bQ8C7I4 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Apol9bQ8C7I4 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Apol9bQ8C7I4 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Apol9bQ8C7I4 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Apol9bQ8C7I4 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Apol9bQ8C7I4 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Apol9bQ8C7I4 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Apol9bQ8C7I4 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Apol9bQ8C7I4 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Apol9bQ8C7I4 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Apol9bQ8C7I4 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Apol9bQ8C7I4 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Apol9bQ8C7I4 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Apol9bQ8C7I4 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Apol9bQ8C7I4 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Apol9bQ8C7I4 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Apol9bQ8C7I4 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Apol9bQ8C7I4 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Apol9bQ8C7I4 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Apol9bQ8C7I4 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Apol9bQ8C7I4 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Apol9bQ8C7I4 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Apol9bQ8C7I4 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Apol9bQ8C7I4 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Apol9bQ8C7I4 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Apol9bQ8C7I4 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Apol9bQ8C7I4 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Apol9bQ8C7I4 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Apol9bQ8C7I4 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Apol9bQ8C7I4 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Apol9bQ8C7I4 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Apol9bQ8C7I4 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Apol9bQ8C7I4 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Apol9bQ8C7I4 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Apol9bQ8C7I4 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Apol9bQ8C7I4 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Apol9bQ8C7I4 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Apol9bQ8C7I4 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Apol9bQ8C7I4 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Apol9bQ8C7I4 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Apol9bQ8C7I4 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Apol9bQ8C7I4 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Apol9bQ8C7I4 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Apol9bQ8C7I4 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Apol9bQ8C7I4 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.4 ms