Protein–RNA interactions for Protein: Q8C4U3

Sfrp1, Secreted frizzled-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfrp1Q8C4U3 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sfrp1Q8C4U3 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sfrp1Q8C4U3 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sfrp1Q8C4U3 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sfrp1Q8C4U3 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sfrp1Q8C4U3 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sfrp1Q8C4U3 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sfrp1Q8C4U3 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sfrp1Q8C4U3 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sfrp1Q8C4U3 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Sfrp1Q8C4U3 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sfrp1Q8C4U3 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sfrp1Q8C4U3 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sfrp1Q8C4U3 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sfrp1Q8C4U3 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sfrp1Q8C4U3 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sfrp1Q8C4U3 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sfrp1Q8C4U3 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sfrp1Q8C4U3 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sfrp1Q8C4U3 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sfrp1Q8C4U3 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sfrp1Q8C4U3 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sfrp1Q8C4U3 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sfrp1Q8C4U3 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sfrp1Q8C4U3 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sfrp1Q8C4U3 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sfrp1Q8C4U3 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sfrp1Q8C4U3 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sfrp1Q8C4U3 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sfrp1Q8C4U3 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sfrp1Q8C4U3 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sfrp1Q8C4U3 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sfrp1Q8C4U3 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sfrp1Q8C4U3 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sfrp1Q8C4U3 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sfrp1Q8C4U3 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Sfrp1Q8C4U3 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sfrp1Q8C4U3 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sfrp1Q8C4U3 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sfrp1Q8C4U3 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sfrp1Q8C4U3 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Sfrp1Q8C4U3 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sfrp1Q8C4U3 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sfrp1Q8C4U3 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sfrp1Q8C4U3 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sfrp1Q8C4U3 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Sfrp1Q8C4U3 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sfrp1Q8C4U3 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sfrp1Q8C4U3 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sfrp1Q8C4U3 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sfrp1Q8C4U3 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sfrp1Q8C4U3 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sfrp1Q8C4U3 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sfrp1Q8C4U3 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Sfrp1Q8C4U3 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sfrp1Q8C4U3 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Sfrp1Q8C4U3 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sfrp1Q8C4U3 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sfrp1Q8C4U3 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sfrp1Q8C4U3 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sfrp1Q8C4U3 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sfrp1Q8C4U3 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sfrp1Q8C4U3 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sfrp1Q8C4U3 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sfrp1Q8C4U3 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sfrp1Q8C4U3 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sfrp1Q8C4U3 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Sfrp1Q8C4U3 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sfrp1Q8C4U3 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sfrp1Q8C4U3 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sfrp1Q8C4U3 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sfrp1Q8C4U3 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sfrp1Q8C4U3 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sfrp1Q8C4U3 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sfrp1Q8C4U3 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sfrp1Q8C4U3 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sfrp1Q8C4U3 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sfrp1Q8C4U3 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sfrp1Q8C4U3 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sfrp1Q8C4U3 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sfrp1Q8C4U3 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Sfrp1Q8C4U3 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sfrp1Q8C4U3 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sfrp1Q8C4U3 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sfrp1Q8C4U3 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sfrp1Q8C4U3 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sfrp1Q8C4U3 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sfrp1Q8C4U3 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sfrp1Q8C4U3 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sfrp1Q8C4U3 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sfrp1Q8C4U3 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sfrp1Q8C4U3 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sfrp1Q8C4U3 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sfrp1Q8C4U3 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sfrp1Q8C4U3 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sfrp1Q8C4U3 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sfrp1Q8C4U3 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sfrp1Q8C4U3 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sfrp1Q8C4U3 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sfrp1Q8C4U3 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms