Protein–RNA interactions for Protein: Q80VN0

Cfap100, Cilia- and flagella-associated protein 100, mousemouse

Predictions only

Length 613 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap100Q80VN0 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cfap100Q80VN0 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cfap100Q80VN0 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cfap100Q80VN0 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Cfap100Q80VN0 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cfap100Q80VN0 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cfap100Q80VN0 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cfap100Q80VN0 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cfap100Q80VN0 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cfap100Q80VN0 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cfap100Q80VN0 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cfap100Q80VN0 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cfap100Q80VN0 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cfap100Q80VN0 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cfap100Q80VN0 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cfap100Q80VN0 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cfap100Q80VN0 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cfap100Q80VN0 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cfap100Q80VN0 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cfap100Q80VN0 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Cfap100Q80VN0 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cfap100Q80VN0 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cfap100Q80VN0 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cfap100Q80VN0 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cfap100Q80VN0 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cfap100Q80VN0 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Cfap100Q80VN0 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Cfap100Q80VN0 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cfap100Q80VN0 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cfap100Q80VN0 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cfap100Q80VN0 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cfap100Q80VN0 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cfap100Q80VN0 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cfap100Q80VN0 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cfap100Q80VN0 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cfap100Q80VN0 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cfap100Q80VN0 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cfap100Q80VN0 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cfap100Q80VN0 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cfap100Q80VN0 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cfap100Q80VN0 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cfap100Q80VN0 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cfap100Q80VN0 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cfap100Q80VN0 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cfap100Q80VN0 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cfap100Q80VN0 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cfap100Q80VN0 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cfap100Q80VN0 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cfap100Q80VN0 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cfap100Q80VN0 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cfap100Q80VN0 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cfap100Q80VN0 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cfap100Q80VN0 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Cfap100Q80VN0 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cfap100Q80VN0 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cfap100Q80VN0 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cfap100Q80VN0 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cfap100Q80VN0 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cfap100Q80VN0 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cfap100Q80VN0 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cfap100Q80VN0 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Cfap100Q80VN0 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cfap100Q80VN0 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cfap100Q80VN0 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cfap100Q80VN0 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cfap100Q80VN0 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cfap100Q80VN0 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cfap100Q80VN0 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cfap100Q80VN0 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cfap100Q80VN0 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cfap100Q80VN0 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Cfap100Q80VN0 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Cfap100Q80VN0 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cfap100Q80VN0 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cfap100Q80VN0 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cfap100Q80VN0 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cfap100Q80VN0 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Cfap100Q80VN0 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cfap100Q80VN0 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cfap100Q80VN0 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cfap100Q80VN0 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cfap100Q80VN0 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cfap100Q80VN0 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cfap100Q80VN0 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cfap100Q80VN0 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cfap100Q80VN0 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cfap100Q80VN0 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cfap100Q80VN0 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cfap100Q80VN0 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cfap100Q80VN0 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cfap100Q80VN0 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cfap100Q80VN0 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cfap100Q80VN0 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cfap100Q80VN0 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cfap100Q80VN0 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cfap100Q80VN0 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cfap100Q80VN0 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cfap100Q80VN0 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cfap100Q80VN0 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cfap100Q80VN0 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
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