Protein–RNA interactions for Protein: Q80VM3

Ttc29, Tetratricopeptide repeat protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc29Q80VM3 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ttc29Q80VM3 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ttc29Q80VM3 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ttc29Q80VM3 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ttc29Q80VM3 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ttc29Q80VM3 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ttc29Q80VM3 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ttc29Q80VM3 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ttc29Q80VM3 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ttc29Q80VM3 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ttc29Q80VM3 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Ttc29Q80VM3 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ttc29Q80VM3 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ttc29Q80VM3 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Ttc29Q80VM3 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ttc29Q80VM3 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ttc29Q80VM3 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ttc29Q80VM3 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Ttc29Q80VM3 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Ttc29Q80VM3 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ttc29Q80VM3 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ttc29Q80VM3 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ttc29Q80VM3 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ttc29Q80VM3 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ttc29Q80VM3 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ttc29Q80VM3 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ttc29Q80VM3 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ttc29Q80VM3 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ttc29Q80VM3 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ttc29Q80VM3 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ttc29Q80VM3 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Ttc29Q80VM3 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ttc29Q80VM3 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ttc29Q80VM3 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Ttc29Q80VM3 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ttc29Q80VM3 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ttc29Q80VM3 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ttc29Q80VM3 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ttc29Q80VM3 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Ttc29Q80VM3 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ttc29Q80VM3 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ttc29Q80VM3 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ttc29Q80VM3 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Ttc29Q80VM3 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ttc29Q80VM3 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Ttc29Q80VM3 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ttc29Q80VM3 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ttc29Q80VM3 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Ttc29Q80VM3 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ttc29Q80VM3 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ttc29Q80VM3 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ttc29Q80VM3 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ttc29Q80VM3 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ttc29Q80VM3 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ttc29Q80VM3 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Ttc29Q80VM3 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ttc29Q80VM3 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ttc29Q80VM3 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ttc29Q80VM3 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ttc29Q80VM3 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ttc29Q80VM3 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Ttc29Q80VM3 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ttc29Q80VM3 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ttc29Q80VM3 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ttc29Q80VM3 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ttc29Q80VM3 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ttc29Q80VM3 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ttc29Q80VM3 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ttc29Q80VM3 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ttc29Q80VM3 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ttc29Q80VM3 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ttc29Q80VM3 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ttc29Q80VM3 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ttc29Q80VM3 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Ttc29Q80VM3 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ttc29Q80VM3 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ttc29Q80VM3 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Ttc29Q80VM3 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ttc29Q80VM3 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ttc29Q80VM3 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Ttc29Q80VM3 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ttc29Q80VM3 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ttc29Q80VM3 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ttc29Q80VM3 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ttc29Q80VM3 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ttc29Q80VM3 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ttc29Q80VM3 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ttc29Q80VM3 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Ttc29Q80VM3 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ttc29Q80VM3 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ttc29Q80VM3 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ttc29Q80VM3 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ttc29Q80VM3 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ttc29Q80VM3 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ttc29Q80VM3 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ttc29Q80VM3 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ttc29Q80VM3 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ttc29Q80VM3 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ttc29Q80VM3 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ttc29Q80VM3 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
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