Protein–RNA interactions for Protein: Q80V62

Fancd2, Fanconi anemia group D2 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fancd2Q80V62 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.2■■■■□ 3.39
Fancd2Q80V62 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC36.2■■■■□ 3.39
Fancd2Q80V62 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
Fancd2Q80V62 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.38
Fancd2Q80V62 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
Fancd2Q80V62 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC36.18■■■■□ 3.38
Fancd2Q80V62 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
Fancd2Q80V62 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
Fancd2Q80V62 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
Fancd2Q80V62 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC36.18■■■■□ 3.38
Fancd2Q80V62 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
Fancd2Q80V62 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC36.17■■■■□ 3.38
Fancd2Q80V62 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
Fancd2Q80V62 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
Fancd2Q80V62 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
Fancd2Q80V62 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC36.13■■■■□ 3.37
Fancd2Q80V62 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
Fancd2Q80V62 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC36.13■■■■□ 3.37
Fancd2Q80V62 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
Fancd2Q80V62 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
Fancd2Q80V62 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
Fancd2Q80V62 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
Fancd2Q80V62 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.12■■■■□ 3.37
Fancd2Q80V62 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Fancd2Q80V62 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
Fancd2Q80V62 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC36.11■■■■□ 3.37
Fancd2Q80V62 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
Fancd2Q80V62 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Fancd2Q80V62 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC36.11■■■■□ 3.37
Fancd2Q80V62 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.1■■■■□ 3.37
Fancd2Q80V62 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
Fancd2Q80V62 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC36.07■■■■□ 3.37
Fancd2Q80V62 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
Fancd2Q80V62 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC36.06■■■■□ 3.36
Fancd2Q80V62 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
Fancd2Q80V62 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
Fancd2Q80V62 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
Fancd2Q80V62 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
Fancd2Q80V62 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
Fancd2Q80V62 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
Fancd2Q80V62 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
Fancd2Q80V62 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC36.03■■■■□ 3.36
Fancd2Q80V62 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC36.03■■■■□ 3.36
Fancd2Q80V62 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC36.02■■■■□ 3.36
Fancd2Q80V62 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
Fancd2Q80V62 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
Fancd2Q80V62 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
Fancd2Q80V62 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
Fancd2Q80V62 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
Fancd2Q80V62 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
Fancd2Q80V62 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
Fancd2Q80V62 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC35.99■■■■□ 3.35
Fancd2Q80V62 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
Fancd2Q80V62 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
Fancd2Q80V62 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
Fancd2Q80V62 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC35.98■■■■□ 3.35
Fancd2Q80V62 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC35.97■■■■□ 3.35
Fancd2Q80V62 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
Fancd2Q80V62 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC35.96■■■■□ 3.35
Fancd2Q80V62 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.96■■■■□ 3.35
Fancd2Q80V62 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
Fancd2Q80V62 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC35.96■■■■□ 3.35
Fancd2Q80V62 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC35.95■■■■□ 3.35
Fancd2Q80V62 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
Fancd2Q80V62 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
Fancd2Q80V62 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
Fancd2Q80V62 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.95■■■■□ 3.34
Fancd2Q80V62 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
Fancd2Q80V62 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
Fancd2Q80V62 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Fancd2Q80V62 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC35.93■■■■□ 3.34
Fancd2Q80V62 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Fancd2Q80V62 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC35.93■■■■□ 3.34
Fancd2Q80V62 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC35.92■■■■□ 3.34
Fancd2Q80V62 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC35.92■■■■□ 3.34
Fancd2Q80V62 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
Fancd2Q80V62 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
Fancd2Q80V62 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
Fancd2Q80V62 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
Fancd2Q80V62 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
Fancd2Q80V62 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.9■■■■□ 3.34
Fancd2Q80V62 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
Fancd2Q80V62 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC35.9■■■■□ 3.34
Fancd2Q80V62 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
Fancd2Q80V62 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
Fancd2Q80V62 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
Fancd2Q80V62 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC35.86■■■■□ 3.33
Fancd2Q80V62 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC35.85■■■■□ 3.33
Fancd2Q80V62 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.85■■■■□ 3.33
Fancd2Q80V62 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
Fancd2Q80V62 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
Fancd2Q80V62 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC35.83■■■■□ 3.33
Fancd2Q80V62 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.83■■■■□ 3.33
Fancd2Q80V62 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC35.82■■■■□ 3.32
Fancd2Q80V62 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC35.82■■■■□ 3.32
Fancd2Q80V62 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC35.82■■■■□ 3.32
Fancd2Q80V62 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
Fancd2Q80V62 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
Fancd2Q80V62 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
Fancd2Q80V62 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC35.78■■■■□ 3.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms