Protein–RNA interactions for Protein: Q78HU7

Gypc, Glycophorin-C, mousemouse

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Length 95 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GypcQ78HU7 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GypcQ78HU7 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GypcQ78HU7 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GypcQ78HU7 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GypcQ78HU7 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
GypcQ78HU7 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GypcQ78HU7 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GypcQ78HU7 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GypcQ78HU7 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GypcQ78HU7 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GypcQ78HU7 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GypcQ78HU7 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GypcQ78HU7 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GypcQ78HU7 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GypcQ78HU7 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
GypcQ78HU7 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
GypcQ78HU7 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GypcQ78HU7 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
GypcQ78HU7 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GypcQ78HU7 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GypcQ78HU7 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GypcQ78HU7 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GypcQ78HU7 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GypcQ78HU7 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GypcQ78HU7 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GypcQ78HU7 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GypcQ78HU7 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
GypcQ78HU7 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
GypcQ78HU7 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
GypcQ78HU7 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
GypcQ78HU7 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GypcQ78HU7 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GypcQ78HU7 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GypcQ78HU7 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GypcQ78HU7 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GypcQ78HU7 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
GypcQ78HU7 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
GypcQ78HU7 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GypcQ78HU7 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
GypcQ78HU7 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GypcQ78HU7 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GypcQ78HU7 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GypcQ78HU7 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GypcQ78HU7 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
GypcQ78HU7 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
GypcQ78HU7 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
GypcQ78HU7 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
GypcQ78HU7 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GypcQ78HU7 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GypcQ78HU7 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
GypcQ78HU7 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GypcQ78HU7 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GypcQ78HU7 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
GypcQ78HU7 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GypcQ78HU7 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GypcQ78HU7 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GypcQ78HU7 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
GypcQ78HU7 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
GypcQ78HU7 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GypcQ78HU7 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GypcQ78HU7 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GypcQ78HU7 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GypcQ78HU7 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GypcQ78HU7 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
GypcQ78HU7 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
GypcQ78HU7 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
GypcQ78HU7 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
GypcQ78HU7 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
GypcQ78HU7 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
GypcQ78HU7 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
GypcQ78HU7 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GypcQ78HU7 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GypcQ78HU7 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
GypcQ78HU7 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GypcQ78HU7 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GypcQ78HU7 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GypcQ78HU7 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GypcQ78HU7 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GypcQ78HU7 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GypcQ78HU7 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GypcQ78HU7 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GypcQ78HU7 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GypcQ78HU7 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GypcQ78HU7 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
GypcQ78HU7 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GypcQ78HU7 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GypcQ78HU7 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GypcQ78HU7 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GypcQ78HU7 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GypcQ78HU7 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GypcQ78HU7 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GypcQ78HU7 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GypcQ78HU7 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GypcQ78HU7 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GypcQ78HU7 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GypcQ78HU7 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GypcQ78HU7 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GypcQ78HU7 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GypcQ78HU7 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GypcQ78HU7 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
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