Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPR5

Smpd4, Sphingomyelin phosphodiesterase 4, mousemouse

Predictions only

Length 823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd4Q6ZPR5 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Smpd4Q6ZPR5 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Smpd4Q6ZPR5 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Smpd4Q6ZPR5 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Smpd4Q6ZPR5 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Smpd4Q6ZPR5 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Smpd4Q6ZPR5 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Smpd4Q6ZPR5 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Smpd4Q6ZPR5 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Smpd4Q6ZPR5 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Smpd4Q6ZPR5 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Smpd4Q6ZPR5 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Smpd4Q6ZPR5 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Smpd4Q6ZPR5 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Smpd4Q6ZPR5 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Smpd4Q6ZPR5 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Smpd4Q6ZPR5 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Smpd4Q6ZPR5 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Smpd4Q6ZPR5 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Smpd4Q6ZPR5 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Smpd4Q6ZPR5 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Smpd4Q6ZPR5 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Smpd4Q6ZPR5 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Smpd4Q6ZPR5 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Smpd4Q6ZPR5 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Smpd4Q6ZPR5 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Smpd4Q6ZPR5 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Smpd4Q6ZPR5 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Smpd4Q6ZPR5 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Smpd4Q6ZPR5 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Smpd4Q6ZPR5 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Smpd4Q6ZPR5 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Smpd4Q6ZPR5 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Smpd4Q6ZPR5 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Smpd4Q6ZPR5 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Smpd4Q6ZPR5 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Smpd4Q6ZPR5 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Smpd4Q6ZPR5 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Smpd4Q6ZPR5 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Smpd4Q6ZPR5 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Smpd4Q6ZPR5 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Smpd4Q6ZPR5 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Smpd4Q6ZPR5 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Smpd4Q6ZPR5 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Smpd4Q6ZPR5 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Smpd4Q6ZPR5 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Smpd4Q6ZPR5 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Smpd4Q6ZPR5 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Smpd4Q6ZPR5 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Smpd4Q6ZPR5 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Smpd4Q6ZPR5 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Smpd4Q6ZPR5 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Smpd4Q6ZPR5 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Smpd4Q6ZPR5 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Smpd4Q6ZPR5 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Smpd4Q6ZPR5 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Smpd4Q6ZPR5 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Smpd4Q6ZPR5 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Smpd4Q6ZPR5 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Smpd4Q6ZPR5 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Smpd4Q6ZPR5 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Smpd4Q6ZPR5 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Smpd4Q6ZPR5 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Smpd4Q6ZPR5 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Smpd4Q6ZPR5 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Smpd4Q6ZPR5 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Smpd4Q6ZPR5 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Smpd4Q6ZPR5 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Smpd4Q6ZPR5 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Smpd4Q6ZPR5 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Smpd4Q6ZPR5 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Smpd4Q6ZPR5 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Smpd4Q6ZPR5 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Smpd4Q6ZPR5 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Smpd4Q6ZPR5 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Smpd4Q6ZPR5 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Smpd4Q6ZPR5 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Smpd4Q6ZPR5 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Smpd4Q6ZPR5 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Smpd4Q6ZPR5 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Smpd4Q6ZPR5 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Smpd4Q6ZPR5 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Smpd4Q6ZPR5 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Smpd4Q6ZPR5 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Smpd4Q6ZPR5 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Smpd4Q6ZPR5 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Smpd4Q6ZPR5 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Smpd4Q6ZPR5 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Smpd4Q6ZPR5 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Smpd4Q6ZPR5 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Smpd4Q6ZPR5 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Smpd4Q6ZPR5 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Smpd4Q6ZPR5 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Smpd4Q6ZPR5 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Smpd4Q6ZPR5 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Smpd4Q6ZPR5 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Smpd4Q6ZPR5 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Smpd4Q6ZPR5 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Smpd4Q6ZPR5 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Smpd4Q6ZPR5 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.7 ms