Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCX9

Trim37, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM37, mousemouse

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim37Q6PCX9 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Trim37Q6PCX9 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Trim37Q6PCX9 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Trim37Q6PCX9 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Trim37Q6PCX9 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Trim37Q6PCX9 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Trim37Q6PCX9 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Trim37Q6PCX9 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Trim37Q6PCX9 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Trim37Q6PCX9 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Trim37Q6PCX9 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Trim37Q6PCX9 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Trim37Q6PCX9 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Trim37Q6PCX9 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Trim37Q6PCX9 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Trim37Q6PCX9 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Trim37Q6PCX9 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Trim37Q6PCX9 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Trim37Q6PCX9 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Trim37Q6PCX9 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Trim37Q6PCX9 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Trim37Q6PCX9 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Trim37Q6PCX9 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Trim37Q6PCX9 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Trim37Q6PCX9 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Trim37Q6PCX9 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Trim37Q6PCX9 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Trim37Q6PCX9 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Trim37Q6PCX9 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Trim37Q6PCX9 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Trim37Q6PCX9 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Trim37Q6PCX9 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Trim37Q6PCX9 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Trim37Q6PCX9 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Trim37Q6PCX9 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Trim37Q6PCX9 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Trim37Q6PCX9 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Trim37Q6PCX9 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Trim37Q6PCX9 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Trim37Q6PCX9 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Trim37Q6PCX9 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Trim37Q6PCX9 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Trim37Q6PCX9 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Trim37Q6PCX9 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Trim37Q6PCX9 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Trim37Q6PCX9 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Trim37Q6PCX9 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Trim37Q6PCX9 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Trim37Q6PCX9 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Trim37Q6PCX9 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Trim37Q6PCX9 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Trim37Q6PCX9 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Trim37Q6PCX9 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Trim37Q6PCX9 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Trim37Q6PCX9 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Trim37Q6PCX9 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Trim37Q6PCX9 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Trim37Q6PCX9 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Trim37Q6PCX9 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Trim37Q6PCX9 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Trim37Q6PCX9 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Trim37Q6PCX9 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Trim37Q6PCX9 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Trim37Q6PCX9 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Trim37Q6PCX9 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Trim37Q6PCX9 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Trim37Q6PCX9 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Trim37Q6PCX9 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Trim37Q6PCX9 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Trim37Q6PCX9 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Trim37Q6PCX9 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Trim37Q6PCX9 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Trim37Q6PCX9 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Trim37Q6PCX9 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Trim37Q6PCX9 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Trim37Q6PCX9 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Trim37Q6PCX9 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Trim37Q6PCX9 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Trim37Q6PCX9 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Trim37Q6PCX9 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Trim37Q6PCX9 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Trim37Q6PCX9 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Trim37Q6PCX9 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Trim37Q6PCX9 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Trim37Q6PCX9 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Trim37Q6PCX9 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Trim37Q6PCX9 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Trim37Q6PCX9 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Trim37Q6PCX9 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Trim37Q6PCX9 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Trim37Q6PCX9 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Trim37Q6PCX9 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Trim37Q6PCX9 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Trim37Q6PCX9 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Trim37Q6PCX9 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Trim37Q6PCX9 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Trim37Q6PCX9 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Trim37Q6PCX9 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Trim37Q6PCX9 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Trim37Q6PCX9 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms