Protein–RNA interactions for Protein: Q64519

Sdc3, Syndecan-3, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc3Q64519 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Sdc3Q64519 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sdc3Q64519 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sdc3Q64519 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sdc3Q64519 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sdc3Q64519 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sdc3Q64519 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sdc3Q64519 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sdc3Q64519 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sdc3Q64519 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sdc3Q64519 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sdc3Q64519 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sdc3Q64519 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sdc3Q64519 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sdc3Q64519 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sdc3Q64519 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Sdc3Q64519 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Sdc3Q64519 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Sdc3Q64519 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sdc3Q64519 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sdc3Q64519 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Sdc3Q64519 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sdc3Q64519 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sdc3Q64519 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sdc3Q64519 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sdc3Q64519 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sdc3Q64519 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sdc3Q64519 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sdc3Q64519 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sdc3Q64519 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sdc3Q64519 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sdc3Q64519 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sdc3Q64519 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sdc3Q64519 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sdc3Q64519 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Sdc3Q64519 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sdc3Q64519 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sdc3Q64519 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sdc3Q64519 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Sdc3Q64519 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sdc3Q64519 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sdc3Q64519 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sdc3Q64519 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sdc3Q64519 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sdc3Q64519 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sdc3Q64519 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sdc3Q64519 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sdc3Q64519 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Sdc3Q64519 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sdc3Q64519 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sdc3Q64519 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sdc3Q64519 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sdc3Q64519 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sdc3Q64519 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sdc3Q64519 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sdc3Q64519 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sdc3Q64519 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sdc3Q64519 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sdc3Q64519 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sdc3Q64519 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sdc3Q64519 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sdc3Q64519 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Sdc3Q64519 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sdc3Q64519 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sdc3Q64519 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sdc3Q64519 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sdc3Q64519 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sdc3Q64519 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sdc3Q64519 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Sdc3Q64519 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Sdc3Q64519 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sdc3Q64519 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sdc3Q64519 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sdc3Q64519 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sdc3Q64519 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sdc3Q64519 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sdc3Q64519 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sdc3Q64519 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sdc3Q64519 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sdc3Q64519 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Sdc3Q64519 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sdc3Q64519 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sdc3Q64519 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Sdc3Q64519 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sdc3Q64519 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sdc3Q64519 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sdc3Q64519 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sdc3Q64519 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sdc3Q64519 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sdc3Q64519 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sdc3Q64519 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sdc3Q64519 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sdc3Q64519 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sdc3Q64519 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Sdc3Q64519 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sdc3Q64519 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sdc3Q64519 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sdc3Q64519 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Sdc3Q64519 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sdc3Q64519 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms