Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWD9

Tsr1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsr1Q5SWD9 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tsr1Q5SWD9 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tsr1Q5SWD9 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tsr1Q5SWD9 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tsr1Q5SWD9 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tsr1Q5SWD9 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tsr1Q5SWD9 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tsr1Q5SWD9 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tsr1Q5SWD9 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tsr1Q5SWD9 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tsr1Q5SWD9 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tsr1Q5SWD9 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tsr1Q5SWD9 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tsr1Q5SWD9 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tsr1Q5SWD9 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tsr1Q5SWD9 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tsr1Q5SWD9 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tsr1Q5SWD9 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tsr1Q5SWD9 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tsr1Q5SWD9 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tsr1Q5SWD9 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tsr1Q5SWD9 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tsr1Q5SWD9 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tsr1Q5SWD9 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tsr1Q5SWD9 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tsr1Q5SWD9 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tsr1Q5SWD9 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tsr1Q5SWD9 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tsr1Q5SWD9 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tsr1Q5SWD9 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tsr1Q5SWD9 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tsr1Q5SWD9 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tsr1Q5SWD9 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Tsr1Q5SWD9 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tsr1Q5SWD9 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tsr1Q5SWD9 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tsr1Q5SWD9 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tsr1Q5SWD9 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tsr1Q5SWD9 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tsr1Q5SWD9 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tsr1Q5SWD9 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tsr1Q5SWD9 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tsr1Q5SWD9 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tsr1Q5SWD9 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tsr1Q5SWD9 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tsr1Q5SWD9 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tsr1Q5SWD9 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tsr1Q5SWD9 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tsr1Q5SWD9 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tsr1Q5SWD9 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tsr1Q5SWD9 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tsr1Q5SWD9 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tsr1Q5SWD9 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tsr1Q5SWD9 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tsr1Q5SWD9 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tsr1Q5SWD9 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tsr1Q5SWD9 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tsr1Q5SWD9 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tsr1Q5SWD9 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tsr1Q5SWD9 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tsr1Q5SWD9 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tsr1Q5SWD9 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tsr1Q5SWD9 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tsr1Q5SWD9 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tsr1Q5SWD9 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tsr1Q5SWD9 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tsr1Q5SWD9 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tsr1Q5SWD9 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tsr1Q5SWD9 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tsr1Q5SWD9 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tsr1Q5SWD9 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tsr1Q5SWD9 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tsr1Q5SWD9 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tsr1Q5SWD9 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tsr1Q5SWD9 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tsr1Q5SWD9 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tsr1Q5SWD9 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tsr1Q5SWD9 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tsr1Q5SWD9 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tsr1Q5SWD9 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tsr1Q5SWD9 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tsr1Q5SWD9 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tsr1Q5SWD9 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tsr1Q5SWD9 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tsr1Q5SWD9 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tsr1Q5SWD9 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tsr1Q5SWD9 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tsr1Q5SWD9 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tsr1Q5SWD9 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tsr1Q5SWD9 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tsr1Q5SWD9 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tsr1Q5SWD9 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tsr1Q5SWD9 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tsr1Q5SWD9 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tsr1Q5SWD9 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tsr1Q5SWD9 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tsr1Q5SWD9 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tsr1Q5SWD9 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tsr1Q5SWD9 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tsr1Q5SWD9 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms