Protein–RNA interactions for Protein: Q5NC05

Ttf2, Transcription termination factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttf2Q5NC05 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ttf2Q5NC05 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ttf2Q5NC05 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ttf2Q5NC05 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ttf2Q5NC05 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ttf2Q5NC05 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ttf2Q5NC05 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ttf2Q5NC05 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ttf2Q5NC05 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ttf2Q5NC05 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ttf2Q5NC05 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ttf2Q5NC05 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ttf2Q5NC05 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ttf2Q5NC05 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ttf2Q5NC05 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ttf2Q5NC05 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ttf2Q5NC05 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ttf2Q5NC05 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ttf2Q5NC05 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ttf2Q5NC05 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ttf2Q5NC05 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ttf2Q5NC05 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ttf2Q5NC05 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ttf2Q5NC05 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ttf2Q5NC05 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ttf2Q5NC05 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ttf2Q5NC05 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ttf2Q5NC05 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ttf2Q5NC05 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ttf2Q5NC05 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ttf2Q5NC05 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ttf2Q5NC05 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ttf2Q5NC05 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ttf2Q5NC05 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ttf2Q5NC05 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ttf2Q5NC05 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ttf2Q5NC05 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ttf2Q5NC05 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Ttf2Q5NC05 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Ttf2Q5NC05 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ttf2Q5NC05 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ttf2Q5NC05 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ttf2Q5NC05 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ttf2Q5NC05 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ttf2Q5NC05 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ttf2Q5NC05 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ttf2Q5NC05 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ttf2Q5NC05 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ttf2Q5NC05 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ttf2Q5NC05 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ttf2Q5NC05 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ttf2Q5NC05 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ttf2Q5NC05 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ttf2Q5NC05 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ttf2Q5NC05 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Ttf2Q5NC05 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ttf2Q5NC05 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ttf2Q5NC05 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ttf2Q5NC05 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ttf2Q5NC05 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ttf2Q5NC05 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ttf2Q5NC05 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ttf2Q5NC05 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ttf2Q5NC05 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ttf2Q5NC05 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ttf2Q5NC05 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ttf2Q5NC05 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ttf2Q5NC05 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ttf2Q5NC05 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ttf2Q5NC05 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ttf2Q5NC05 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ttf2Q5NC05 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ttf2Q5NC05 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ttf2Q5NC05 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ttf2Q5NC05 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ttf2Q5NC05 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ttf2Q5NC05 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ttf2Q5NC05 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ttf2Q5NC05 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ttf2Q5NC05 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ttf2Q5NC05 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Ttf2Q5NC05 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ttf2Q5NC05 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ttf2Q5NC05 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ttf2Q5NC05 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ttf2Q5NC05 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ttf2Q5NC05 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ttf2Q5NC05 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ttf2Q5NC05 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ttf2Q5NC05 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ttf2Q5NC05 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ttf2Q5NC05 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ttf2Q5NC05 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Ttf2Q5NC05 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ttf2Q5NC05 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ttf2Q5NC05 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ttf2Q5NC05 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ttf2Q5NC05 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ttf2Q5NC05 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ttf2Q5NC05 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms