Protein–RNA interactions for Protein: Q5FWC9

Gm3558, Predicted gene 3558, mousemouse

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3558Q5FWC9 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm3558Q5FWC9 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm3558Q5FWC9 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm3558Q5FWC9 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm3558Q5FWC9 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm3558Q5FWC9 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm3558Q5FWC9 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm3558Q5FWC9 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm3558Q5FWC9 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm3558Q5FWC9 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm3558Q5FWC9 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm3558Q5FWC9 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm3558Q5FWC9 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gm3558Q5FWC9 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gm3558Q5FWC9 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm3558Q5FWC9 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm3558Q5FWC9 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm3558Q5FWC9 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm3558Q5FWC9 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm3558Q5FWC9 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm3558Q5FWC9 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm3558Q5FWC9 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm3558Q5FWC9 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm3558Q5FWC9 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm3558Q5FWC9 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm3558Q5FWC9 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm3558Q5FWC9 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm3558Q5FWC9 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm3558Q5FWC9 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm3558Q5FWC9 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm3558Q5FWC9 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm3558Q5FWC9 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm3558Q5FWC9 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm3558Q5FWC9 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm3558Q5FWC9 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm3558Q5FWC9 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm3558Q5FWC9 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm3558Q5FWC9 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm3558Q5FWC9 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm3558Q5FWC9 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm3558Q5FWC9 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Gm3558Q5FWC9 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm3558Q5FWC9 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm3558Q5FWC9 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Gm3558Q5FWC9 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm3558Q5FWC9 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm3558Q5FWC9 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm3558Q5FWC9 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm3558Q5FWC9 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm3558Q5FWC9 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm3558Q5FWC9 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm3558Q5FWC9 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm3558Q5FWC9 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm3558Q5FWC9 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm3558Q5FWC9 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm3558Q5FWC9 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm3558Q5FWC9 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm3558Q5FWC9 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm3558Q5FWC9 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm3558Q5FWC9 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm3558Q5FWC9 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm3558Q5FWC9 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm3558Q5FWC9 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm3558Q5FWC9 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm3558Q5FWC9 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm3558Q5FWC9 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm3558Q5FWC9 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm3558Q5FWC9 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm3558Q5FWC9 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm3558Q5FWC9 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm3558Q5FWC9 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm3558Q5FWC9 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm3558Q5FWC9 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm3558Q5FWC9 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm3558Q5FWC9 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm3558Q5FWC9 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm3558Q5FWC9 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm3558Q5FWC9 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm3558Q5FWC9 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm3558Q5FWC9 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm3558Q5FWC9 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm3558Q5FWC9 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm3558Q5FWC9 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm3558Q5FWC9 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm3558Q5FWC9 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm3558Q5FWC9 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm3558Q5FWC9 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm3558Q5FWC9 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm3558Q5FWC9 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm3558Q5FWC9 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm3558Q5FWC9 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm3558Q5FWC9 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm3558Q5FWC9 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm3558Q5FWC9 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm3558Q5FWC9 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm3558Q5FWC9 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm3558Q5FWC9 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm3558Q5FWC9 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm3558Q5FWC9 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm3558Q5FWC9 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
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