Protein–RNA interactions for Protein: Q3V1D3

Ampd1, AMP deaminase 1, mousemouse

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ampd1Q3V1D3 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ampd1Q3V1D3 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ampd1Q3V1D3 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ampd1Q3V1D3 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ampd1Q3V1D3 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ampd1Q3V1D3 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ampd1Q3V1D3 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ampd1Q3V1D3 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ampd1Q3V1D3 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ampd1Q3V1D3 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ampd1Q3V1D3 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ampd1Q3V1D3 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ampd1Q3V1D3 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ampd1Q3V1D3 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ampd1Q3V1D3 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ampd1Q3V1D3 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ampd1Q3V1D3 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ampd1Q3V1D3 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ampd1Q3V1D3 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ampd1Q3V1D3 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ampd1Q3V1D3 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ampd1Q3V1D3 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ampd1Q3V1D3 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ampd1Q3V1D3 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ampd1Q3V1D3 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Ampd1Q3V1D3 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ampd1Q3V1D3 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ampd1Q3V1D3 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ampd1Q3V1D3 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ampd1Q3V1D3 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ampd1Q3V1D3 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ampd1Q3V1D3 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ampd1Q3V1D3 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ampd1Q3V1D3 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ampd1Q3V1D3 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ampd1Q3V1D3 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ampd1Q3V1D3 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ampd1Q3V1D3 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ampd1Q3V1D3 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Ampd1Q3V1D3 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ampd1Q3V1D3 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ampd1Q3V1D3 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ampd1Q3V1D3 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ampd1Q3V1D3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ampd1Q3V1D3 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ampd1Q3V1D3 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ampd1Q3V1D3 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ampd1Q3V1D3 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ampd1Q3V1D3 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Ampd1Q3V1D3 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ampd1Q3V1D3 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ampd1Q3V1D3 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ampd1Q3V1D3 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ampd1Q3V1D3 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ampd1Q3V1D3 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ampd1Q3V1D3 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ampd1Q3V1D3 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ampd1Q3V1D3 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ampd1Q3V1D3 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ampd1Q3V1D3 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ampd1Q3V1D3 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ampd1Q3V1D3 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ampd1Q3V1D3 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ampd1Q3V1D3 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ampd1Q3V1D3 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ampd1Q3V1D3 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ampd1Q3V1D3 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ampd1Q3V1D3 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ampd1Q3V1D3 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ampd1Q3V1D3 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ampd1Q3V1D3 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ampd1Q3V1D3 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ampd1Q3V1D3 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ampd1Q3V1D3 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ampd1Q3V1D3 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ampd1Q3V1D3 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ampd1Q3V1D3 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ampd1Q3V1D3 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ampd1Q3V1D3 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Ampd1Q3V1D3 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ampd1Q3V1D3 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ampd1Q3V1D3 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Ampd1Q3V1D3 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ampd1Q3V1D3 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ampd1Q3V1D3 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ampd1Q3V1D3 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ampd1Q3V1D3 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ampd1Q3V1D3 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ampd1Q3V1D3 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ampd1Q3V1D3 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ampd1Q3V1D3 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ampd1Q3V1D3 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ampd1Q3V1D3 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ampd1Q3V1D3 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ampd1Q3V1D3 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ampd1Q3V1D3 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ampd1Q3V1D3 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ampd1Q3V1D3 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ampd1Q3V1D3 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.27
Ampd1Q3V1D3 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms