Protein–RNA interactions for Protein: Q3UX62

Ccdc114, Coiled-coil domain-containing protein 114, mousemouse

Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc114Q3UX62 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc114Q3UX62 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc114Q3UX62 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc114Q3UX62 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc114Q3UX62 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc114Q3UX62 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc114Q3UX62 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc114Q3UX62 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc114Q3UX62 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc114Q3UX62 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccdc114Q3UX62 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccdc114Q3UX62 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ccdc114Q3UX62 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc114Q3UX62 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc114Q3UX62 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc114Q3UX62 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc114Q3UX62 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc114Q3UX62 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc114Q3UX62 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc114Q3UX62 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc114Q3UX62 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc114Q3UX62 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc114Q3UX62 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc114Q3UX62 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc114Q3UX62 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc114Q3UX62 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc114Q3UX62 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc114Q3UX62 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc114Q3UX62 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc114Q3UX62 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc114Q3UX62 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc114Q3UX62 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc114Q3UX62 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc114Q3UX62 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc114Q3UX62 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc114Q3UX62 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc114Q3UX62 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc114Q3UX62 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc114Q3UX62 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc114Q3UX62 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc114Q3UX62 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc114Q3UX62 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc114Q3UX62 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc114Q3UX62 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc114Q3UX62 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc114Q3UX62 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc114Q3UX62 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc114Q3UX62 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc114Q3UX62 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc114Q3UX62 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc114Q3UX62 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc114Q3UX62 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc114Q3UX62 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc114Q3UX62 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc114Q3UX62 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc114Q3UX62 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc114Q3UX62 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc114Q3UX62 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc114Q3UX62 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc114Q3UX62 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc114Q3UX62 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc114Q3UX62 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc114Q3UX62 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc114Q3UX62 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc114Q3UX62 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc114Q3UX62 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc114Q3UX62 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc114Q3UX62 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc114Q3UX62 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc114Q3UX62 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc114Q3UX62 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc114Q3UX62 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc114Q3UX62 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc114Q3UX62 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc114Q3UX62 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc114Q3UX62 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc114Q3UX62 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc114Q3UX62 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc114Q3UX62 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc114Q3UX62 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc114Q3UX62 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc114Q3UX62 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc114Q3UX62 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc114Q3UX62 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc114Q3UX62 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc114Q3UX62 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc114Q3UX62 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc114Q3UX62 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc114Q3UX62 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc114Q3UX62 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc114Q3UX62 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc114Q3UX62 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc114Q3UX62 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc114Q3UX62 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc114Q3UX62 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc114Q3UX62 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc114Q3UX62 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc114Q3UX62 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc114Q3UX62 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc114Q3UX62 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms