Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWM4

Kdm7a, Lysine-specific demethylase 7A, mousemouse

Predictions only

Length 940 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm7aQ3UWM4 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Kdm7aQ3UWM4 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Kdm7aQ3UWM4 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Kdm7aQ3UWM4 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Kdm7aQ3UWM4 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Kdm7aQ3UWM4 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Kdm7aQ3UWM4 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Kdm7aQ3UWM4 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Kdm7aQ3UWM4 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Kdm7aQ3UWM4 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Kdm7aQ3UWM4 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Kdm7aQ3UWM4 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Kdm7aQ3UWM4 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Kdm7aQ3UWM4 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Kdm7aQ3UWM4 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Kdm7aQ3UWM4 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Kdm7aQ3UWM4 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Kdm7aQ3UWM4 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Kdm7aQ3UWM4 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Kdm7aQ3UWM4 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Kdm7aQ3UWM4 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Kdm7aQ3UWM4 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Kdm7aQ3UWM4 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Kdm7aQ3UWM4 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Kdm7aQ3UWM4 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Kdm7aQ3UWM4 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Kdm7aQ3UWM4 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Kdm7aQ3UWM4 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Kdm7aQ3UWM4 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Kdm7aQ3UWM4 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Kdm7aQ3UWM4 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Kdm7aQ3UWM4 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Kdm7aQ3UWM4 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Kdm7aQ3UWM4 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Kdm7aQ3UWM4 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Kdm7aQ3UWM4 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Kdm7aQ3UWM4 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Kdm7aQ3UWM4 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Kdm7aQ3UWM4 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Kdm7aQ3UWM4 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Kdm7aQ3UWM4 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Kdm7aQ3UWM4 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Kdm7aQ3UWM4 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Kdm7aQ3UWM4 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Kdm7aQ3UWM4 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Kdm7aQ3UWM4 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Kdm7aQ3UWM4 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Kdm7aQ3UWM4 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Kdm7aQ3UWM4 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Kdm7aQ3UWM4 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Kdm7aQ3UWM4 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Kdm7aQ3UWM4 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Kdm7aQ3UWM4 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Kdm7aQ3UWM4 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Kdm7aQ3UWM4 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Kdm7aQ3UWM4 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Kdm7aQ3UWM4 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Kdm7aQ3UWM4 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Kdm7aQ3UWM4 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Kdm7aQ3UWM4 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Kdm7aQ3UWM4 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Kdm7aQ3UWM4 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Kdm7aQ3UWM4 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Kdm7aQ3UWM4 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Kdm7aQ3UWM4 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Kdm7aQ3UWM4 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Kdm7aQ3UWM4 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Kdm7aQ3UWM4 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Kdm7aQ3UWM4 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Kdm7aQ3UWM4 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Kdm7aQ3UWM4 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Kdm7aQ3UWM4 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Kdm7aQ3UWM4 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Kdm7aQ3UWM4 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Kdm7aQ3UWM4 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Kdm7aQ3UWM4 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Kdm7aQ3UWM4 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Kdm7aQ3UWM4 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Kdm7aQ3UWM4 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Kdm7aQ3UWM4 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Kdm7aQ3UWM4 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Kdm7aQ3UWM4 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Kdm7aQ3UWM4 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Kdm7aQ3UWM4 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Kdm7aQ3UWM4 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Kdm7aQ3UWM4 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Kdm7aQ3UWM4 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Kdm7aQ3UWM4 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Kdm7aQ3UWM4 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Kdm7aQ3UWM4 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Kdm7aQ3UWM4 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Kdm7aQ3UWM4 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Kdm7aQ3UWM4 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Kdm7aQ3UWM4 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Kdm7aQ3UWM4 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Kdm7aQ3UWM4 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Kdm7aQ3UWM4 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Kdm7aQ3UWM4 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Kdm7aQ3UWM4 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Kdm7aQ3UWM4 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms