Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWA4

Trim40, Tripartite motif-containing protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim40Q3UWA4 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trim40Q3UWA4 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trim40Q3UWA4 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trim40Q3UWA4 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trim40Q3UWA4 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trim40Q3UWA4 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trim40Q3UWA4 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trim40Q3UWA4 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trim40Q3UWA4 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trim40Q3UWA4 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trim40Q3UWA4 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trim40Q3UWA4 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trim40Q3UWA4 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trim40Q3UWA4 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trim40Q3UWA4 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trim40Q3UWA4 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trim40Q3UWA4 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trim40Q3UWA4 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Trim40Q3UWA4 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trim40Q3UWA4 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trim40Q3UWA4 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trim40Q3UWA4 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trim40Q3UWA4 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trim40Q3UWA4 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trim40Q3UWA4 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trim40Q3UWA4 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trim40Q3UWA4 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trim40Q3UWA4 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trim40Q3UWA4 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trim40Q3UWA4 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trim40Q3UWA4 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trim40Q3UWA4 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trim40Q3UWA4 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trim40Q3UWA4 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trim40Q3UWA4 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trim40Q3UWA4 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trim40Q3UWA4 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trim40Q3UWA4 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trim40Q3UWA4 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trim40Q3UWA4 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trim40Q3UWA4 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trim40Q3UWA4 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trim40Q3UWA4 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trim40Q3UWA4 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trim40Q3UWA4 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trim40Q3UWA4 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trim40Q3UWA4 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trim40Q3UWA4 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Trim40Q3UWA4 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trim40Q3UWA4 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trim40Q3UWA4 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trim40Q3UWA4 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Trim40Q3UWA4 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Trim40Q3UWA4 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trim40Q3UWA4 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trim40Q3UWA4 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trim40Q3UWA4 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trim40Q3UWA4 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trim40Q3UWA4 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trim40Q3UWA4 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trim40Q3UWA4 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trim40Q3UWA4 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trim40Q3UWA4 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trim40Q3UWA4 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trim40Q3UWA4 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trim40Q3UWA4 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trim40Q3UWA4 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trim40Q3UWA4 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trim40Q3UWA4 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trim40Q3UWA4 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trim40Q3UWA4 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trim40Q3UWA4 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trim40Q3UWA4 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trim40Q3UWA4 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trim40Q3UWA4 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Trim40Q3UWA4 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Trim40Q3UWA4 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Trim40Q3UWA4 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Trim40Q3UWA4 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trim40Q3UWA4 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trim40Q3UWA4 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trim40Q3UWA4 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trim40Q3UWA4 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trim40Q3UWA4 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trim40Q3UWA4 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trim40Q3UWA4 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trim40Q3UWA4 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trim40Q3UWA4 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trim40Q3UWA4 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trim40Q3UWA4 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trim40Q3UWA4 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trim40Q3UWA4 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trim40Q3UWA4 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trim40Q3UWA4 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trim40Q3UWA4 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trim40Q3UWA4 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trim40Q3UWA4 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trim40Q3UWA4 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trim40Q3UWA4 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trim40Q3UWA4 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms