Protein–RNA interactions for Protein: Q3UNB8

Tmem253, Transmembrane protein 253, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem253Q3UNB8 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0,95
Tmem253Q3UNB8 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0,95
Tmem253Q3UNB8 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0,95
Tmem253Q3UNB8 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0,95
Tmem253Q3UNB8 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0,95
Tmem253Q3UNB8 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0,95
Tmem253Q3UNB8 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,99■□□□□ 0,95
Tmem253Q3UNB8 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20,99■□□□□ 0,95
Tmem253Q3UNB8 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20,98■□□□□ 0,95
Tmem253Q3UNB8 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,97■□□□□ 0,95
Tmem253Q3UNB8 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,97■□□□□ 0,95
Tmem253Q3UNB8 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,97■□□□□ 0,95
Tmem253Q3UNB8 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20,97■□□□□ 0,95
Tmem253Q3UNB8 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20,97■□□□□ 0,95
Tmem253Q3UNB8 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,97■□□□□ 0,95
Tmem253Q3UNB8 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,96■□□□□ 0,95
Tmem253Q3UNB8 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20,95■□□□□ 0,95
Tmem253Q3UNB8 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,95■□□□□ 0,94
Tmem253Q3UNB8 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,95■□□□□ 0,94
Tmem253Q3UNB8 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC20,95■□□□□ 0,94
Tmem253Q3UNB8 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC20,95■□□□□ 0,94
Tmem253Q3UNB8 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,95■□□□□ 0,94
Tmem253Q3UNB8 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,94■□□□□ 0,94
Tmem253Q3UNB8 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,94■□□□□ 0,94
Tmem253Q3UNB8 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20,94■□□□□ 0,94
Tmem253Q3UNB8 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,93■□□□□ 0,94
Tmem253Q3UNB8 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC20,93■□□□□ 0,94
Tmem253Q3UNB8 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,93■□□□□ 0,94
Tmem253Q3UNB8 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,92■□□□□ 0,94
Tmem253Q3UNB8 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC20,92■□□□□ 0,94
Tmem253Q3UNB8 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,92■□□□□ 0,94
Tmem253Q3UNB8 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20,92■□□□□ 0,94
Tmem253Q3UNB8 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC20,91■□□□□ 0,94
Tmem253Q3UNB8 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC20,91■□□□□ 0,94
Tmem253Q3UNB8 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,91■□□□□ 0,94
Tmem253Q3UNB8 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20,91■□□□□ 0,94
Tmem253Q3UNB8 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,91■□□□□ 0,94
Tmem253Q3UNB8 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20,9■□□□□ 0,94
Tmem253Q3UNB8 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,9■□□□□ 0,94
Tmem253Q3UNB8 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,9■□□□□ 0,94
Tmem253Q3UNB8 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC20,9■□□□□ 0,94
Tmem253Q3UNB8 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,9■□□□□ 0,94
Tmem253Q3UNB8 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20,9■□□□□ 0,94
Tmem253Q3UNB8 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20,89■□□□□ 0,94
Tmem253Q3UNB8 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,89■□□□□ 0,94
Tmem253Q3UNB8 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,89■□□□□ 0,93
Tmem253Q3UNB8 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,89■□□□□ 0,93
Tmem253Q3UNB8 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC20,89■□□□□ 0,93
Tmem253Q3UNB8 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20,89■□□□□ 0,93
Tmem253Q3UNB8 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,88■□□□□ 0,93
Tmem253Q3UNB8 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,88■□□□□ 0,93
Tmem253Q3UNB8 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC20,88■□□□□ 0,93
Tmem253Q3UNB8 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC20,88■□□□□ 0,93
Tmem253Q3UNB8 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,87■□□□□ 0,93
Tmem253Q3UNB8 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20,87■□□□□ 0,93
Tmem253Q3UNB8 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,87■□□□□ 0,93
Tmem253Q3UNB8 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,87■□□□□ 0,93
Tmem253Q3UNB8 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,87■□□□□ 0,93
Tmem253Q3UNB8 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,86■□□□□ 0,93
Tmem253Q3UNB8 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,86■□□□□ 0,93
Tmem253Q3UNB8 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20,86■□□□□ 0,93
Tmem253Q3UNB8 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20,86■□□□□ 0,93
Tmem253Q3UNB8 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,86■□□□□ 0,93
Tmem253Q3UNB8 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,85■□□□□ 0,93
Tmem253Q3UNB8 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,85■□□□□ 0,93
Tmem253Q3UNB8 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,85■□□□□ 0,93
Tmem253Q3UNB8 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC20,85■□□□□ 0,93
Tmem253Q3UNB8 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC20,85■□□□□ 0,93
Tmem253Q3UNB8 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC20,85■□□□□ 0,93
Tmem253Q3UNB8 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,85■□□□□ 0,93
Tmem253Q3UNB8 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,85■□□□□ 0,93
Tmem253Q3UNB8 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,85■□□□□ 0,93
Tmem253Q3UNB8 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,85■□□□□ 0,93
Tmem253Q3UNB8 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC20,85■□□□□ 0,93
Tmem253Q3UNB8 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,84■□□□□ 0,93
Tmem253Q3UNB8 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC20,84■□□□□ 0,93
Tmem253Q3UNB8 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,84■□□□□ 0,93
Tmem253Q3UNB8 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20,84■□□□□ 0,93
Tmem253Q3UNB8 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,83■□□□□ 0,93
Tmem253Q3UNB8 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,83■□□□□ 0,93
Tmem253Q3UNB8 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20,83■□□□□ 0,93
Tmem253Q3UNB8 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20,83■□□□□ 0,92
Tmem253Q3UNB8 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC20,83■□□□□ 0,92
Tmem253Q3UNB8 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,83■□□□□ 0,92
Tmem253Q3UNB8 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,82■□□□□ 0,92
Tmem253Q3UNB8 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,82■□□□□ 0,92
Tmem253Q3UNB8 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20,82■□□□□ 0,92
Tmem253Q3UNB8 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20,82■□□□□ 0,92
Tmem253Q3UNB8 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,81■□□□□ 0,92
Tmem253Q3UNB8 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,81■□□□□ 0,92
Tmem253Q3UNB8 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,81■□□□□ 0,92
Tmem253Q3UNB8 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,81■□□□□ 0,92
Tmem253Q3UNB8 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20,8■□□□□ 0,92
Tmem253Q3UNB8 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,8■□□□□ 0,92
Tmem253Q3UNB8 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC20,8■□□□□ 0,92
Tmem253Q3UNB8 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC20,8■□□□□ 0,92
Tmem253Q3UNB8 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,8■□□□□ 0,92
Tmem253Q3UNB8 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,8■□□□□ 0,92
Tmem253Q3UNB8 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20,79■□□□□ 0,92
Tmem253Q3UNB8 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20,79■□□□□ 0,92
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