Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3W5

Prmt9, Protein arginine N-methyltransferase 9, mousemouse

Predictions only

Length 846 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prmt9Q3U3W5 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Prmt9Q3U3W5 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Prmt9Q3U3W5 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Prmt9Q3U3W5 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Prmt9Q3U3W5 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Prmt9Q3U3W5 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Prmt9Q3U3W5 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Prmt9Q3U3W5 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Prmt9Q3U3W5 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Prmt9Q3U3W5 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Prmt9Q3U3W5 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Prmt9Q3U3W5 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Prmt9Q3U3W5 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Prmt9Q3U3W5 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Prmt9Q3U3W5 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Prmt9Q3U3W5 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Prmt9Q3U3W5 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Prmt9Q3U3W5 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Prmt9Q3U3W5 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Prmt9Q3U3W5 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Prmt9Q3U3W5 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Prmt9Q3U3W5 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Prmt9Q3U3W5 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Prmt9Q3U3W5 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Prmt9Q3U3W5 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Prmt9Q3U3W5 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Prmt9Q3U3W5 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Prmt9Q3U3W5 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Prmt9Q3U3W5 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Prmt9Q3U3W5 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Prmt9Q3U3W5 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Prmt9Q3U3W5 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Prmt9Q3U3W5 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Prmt9Q3U3W5 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Prmt9Q3U3W5 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Prmt9Q3U3W5 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Prmt9Q3U3W5 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Prmt9Q3U3W5 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Prmt9Q3U3W5 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Prmt9Q3U3W5 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Prmt9Q3U3W5 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Prmt9Q3U3W5 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Prmt9Q3U3W5 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Prmt9Q3U3W5 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Prmt9Q3U3W5 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Prmt9Q3U3W5 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Prmt9Q3U3W5 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prmt9Q3U3W5 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prmt9Q3U3W5 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prmt9Q3U3W5 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Prmt9Q3U3W5 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Prmt9Q3U3W5 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Prmt9Q3U3W5 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Prmt9Q3U3W5 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Prmt9Q3U3W5 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Prmt9Q3U3W5 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Prmt9Q3U3W5 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Prmt9Q3U3W5 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Prmt9Q3U3W5 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Prmt9Q3U3W5 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Prmt9Q3U3W5 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Prmt9Q3U3W5 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prmt9Q3U3W5 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Prmt9Q3U3W5 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Prmt9Q3U3W5 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Prmt9Q3U3W5 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Prmt9Q3U3W5 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Prmt9Q3U3W5 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Prmt9Q3U3W5 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Prmt9Q3U3W5 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Prmt9Q3U3W5 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Prmt9Q3U3W5 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
Prmt9Q3U3W5 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Prmt9Q3U3W5 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Prmt9Q3U3W5 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Prmt9Q3U3W5 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Prmt9Q3U3W5 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Prmt9Q3U3W5 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Prmt9Q3U3W5 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Prmt9Q3U3W5 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Prmt9Q3U3W5 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Prmt9Q3U3W5 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Prmt9Q3U3W5 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Prmt9Q3U3W5 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Prmt9Q3U3W5 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Prmt9Q3U3W5 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Prmt9Q3U3W5 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Prmt9Q3U3W5 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Prmt9Q3U3W5 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Prmt9Q3U3W5 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Prmt9Q3U3W5 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Prmt9Q3U3W5 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Prmt9Q3U3W5 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Prmt9Q3U3W5 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Prmt9Q3U3W5 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Prmt9Q3U3W5 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Prmt9Q3U3W5 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Prmt9Q3U3W5 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Prmt9Q3U3W5 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Prmt9Q3U3W5 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.5 ms