Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3E2

Fam117b, Protein FAM117B, mousemouse

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Length 584 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam117bQ3U3E2 Gm19891-201ENSMUST00000189771 303 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Fam117bQ3U3E2 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fam117bQ3U3E2 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fam117bQ3U3E2 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fam117bQ3U3E2 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fam117bQ3U3E2 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fam117bQ3U3E2 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fam117bQ3U3E2 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fam117bQ3U3E2 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Fam117bQ3U3E2 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fam117bQ3U3E2 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fam117bQ3U3E2 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fam117bQ3U3E2 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fam117bQ3U3E2 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Fam117bQ3U3E2 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fam117bQ3U3E2 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fam117bQ3U3E2 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Fam117bQ3U3E2 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fam117bQ3U3E2 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fam117bQ3U3E2 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fam117bQ3U3E2 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Fam117bQ3U3E2 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fam117bQ3U3E2 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fam117bQ3U3E2 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fam117bQ3U3E2 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fam117bQ3U3E2 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fam117bQ3U3E2 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fam117bQ3U3E2 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fam117bQ3U3E2 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fam117bQ3U3E2 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fam117bQ3U3E2 Rpl7-201ENSMUST00000058437 1163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fam117bQ3U3E2 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fam117bQ3U3E2 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fam117bQ3U3E2 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fam117bQ3U3E2 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fam117bQ3U3E2 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fam117bQ3U3E2 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fam117bQ3U3E2 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fam117bQ3U3E2 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fam117bQ3U3E2 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fam117bQ3U3E2 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fam117bQ3U3E2 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fam117bQ3U3E2 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Fam117bQ3U3E2 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fam117bQ3U3E2 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Fam117bQ3U3E2 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fam117bQ3U3E2 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fam117bQ3U3E2 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fam117bQ3U3E2 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fam117bQ3U3E2 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fam117bQ3U3E2 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fam117bQ3U3E2 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fam117bQ3U3E2 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fam117bQ3U3E2 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fam117bQ3U3E2 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fam117bQ3U3E2 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fam117bQ3U3E2 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fam117bQ3U3E2 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fam117bQ3U3E2 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fam117bQ3U3E2 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fam117bQ3U3E2 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fam117bQ3U3E2 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fam117bQ3U3E2 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fam117bQ3U3E2 mt-Rnr1-201ENSMUST00000082388 955 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Fam117bQ3U3E2 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fam117bQ3U3E2 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fam117bQ3U3E2 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fam117bQ3U3E2 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fam117bQ3U3E2 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fam117bQ3U3E2 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fam117bQ3U3E2 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fam117bQ3U3E2 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fam117bQ3U3E2 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fam117bQ3U3E2 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Fam117bQ3U3E2 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fam117bQ3U3E2 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fam117bQ3U3E2 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fam117bQ3U3E2 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fam117bQ3U3E2 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fam117bQ3U3E2 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fam117bQ3U3E2 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fam117bQ3U3E2 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fam117bQ3U3E2 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fam117bQ3U3E2 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fam117bQ3U3E2 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fam117bQ3U3E2 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Fam117bQ3U3E2 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fam117bQ3U3E2 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fam117bQ3U3E2 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fam117bQ3U3E2 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fam117bQ3U3E2 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fam117bQ3U3E2 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fam117bQ3U3E2 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fam117bQ3U3E2 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fam117bQ3U3E2 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fam117bQ3U3E2 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Fam117bQ3U3E2 Gm43356-201ENSMUST00000196582 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fam117bQ3U3E2 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fam117bQ3U3E2 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fam117bQ3U3E2 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
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