Protein–RNA interactions for Protein: Q3TDK6

Rogdi, Protein rogdi homolog, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RogdiQ3TDK6 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RogdiQ3TDK6 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RogdiQ3TDK6 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RogdiQ3TDK6 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RogdiQ3TDK6 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RogdiQ3TDK6 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RogdiQ3TDK6 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RogdiQ3TDK6 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RogdiQ3TDK6 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RogdiQ3TDK6 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RogdiQ3TDK6 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RogdiQ3TDK6 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RogdiQ3TDK6 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RogdiQ3TDK6 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RogdiQ3TDK6 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RogdiQ3TDK6 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RogdiQ3TDK6 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RogdiQ3TDK6 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RogdiQ3TDK6 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RogdiQ3TDK6 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RogdiQ3TDK6 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RogdiQ3TDK6 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RogdiQ3TDK6 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RogdiQ3TDK6 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RogdiQ3TDK6 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RogdiQ3TDK6 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RogdiQ3TDK6 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RogdiQ3TDK6 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RogdiQ3TDK6 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RogdiQ3TDK6 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RogdiQ3TDK6 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RogdiQ3TDK6 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RogdiQ3TDK6 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RogdiQ3TDK6 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RogdiQ3TDK6 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RogdiQ3TDK6 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RogdiQ3TDK6 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RogdiQ3TDK6 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RogdiQ3TDK6 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RogdiQ3TDK6 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
RogdiQ3TDK6 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RogdiQ3TDK6 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RogdiQ3TDK6 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RogdiQ3TDK6 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RogdiQ3TDK6 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RogdiQ3TDK6 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RogdiQ3TDK6 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RogdiQ3TDK6 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RogdiQ3TDK6 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RogdiQ3TDK6 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RogdiQ3TDK6 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RogdiQ3TDK6 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RogdiQ3TDK6 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RogdiQ3TDK6 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RogdiQ3TDK6 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RogdiQ3TDK6 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RogdiQ3TDK6 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RogdiQ3TDK6 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RogdiQ3TDK6 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RogdiQ3TDK6 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RogdiQ3TDK6 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RogdiQ3TDK6 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RogdiQ3TDK6 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RogdiQ3TDK6 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RogdiQ3TDK6 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RogdiQ3TDK6 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RogdiQ3TDK6 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RogdiQ3TDK6 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RogdiQ3TDK6 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RogdiQ3TDK6 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RogdiQ3TDK6 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RogdiQ3TDK6 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RogdiQ3TDK6 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RogdiQ3TDK6 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RogdiQ3TDK6 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RogdiQ3TDK6 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RogdiQ3TDK6 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RogdiQ3TDK6 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RogdiQ3TDK6 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RogdiQ3TDK6 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RogdiQ3TDK6 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RogdiQ3TDK6 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RogdiQ3TDK6 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RogdiQ3TDK6 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RogdiQ3TDK6 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RogdiQ3TDK6 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
RogdiQ3TDK6 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RogdiQ3TDK6 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RogdiQ3TDK6 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RogdiQ3TDK6 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RogdiQ3TDK6 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RogdiQ3TDK6 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RogdiQ3TDK6 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RogdiQ3TDK6 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RogdiQ3TDK6 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RogdiQ3TDK6 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RogdiQ3TDK6 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RogdiQ3TDK6 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RogdiQ3TDK6 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RogdiQ3TDK6 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.3 ms