Protein–RNA interactions for Protein: Q32NY4

Cnnm3, Metal transporter CNNM3, mousemouse

Predictions only

Length 713 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnnm3Q32NY4 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Cnnm3Q32NY4 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Cnnm3Q32NY4 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Cnnm3Q32NY4 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Cnnm3Q32NY4 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Cnnm3Q32NY4 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Cnnm3Q32NY4 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Cnnm3Q32NY4 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cnnm3Q32NY4 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cnnm3Q32NY4 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Cnnm3Q32NY4 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Cnnm3Q32NY4 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Cnnm3Q32NY4 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Cnnm3Q32NY4 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Cnnm3Q32NY4 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cnnm3Q32NY4 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cnnm3Q32NY4 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cnnm3Q32NY4 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cnnm3Q32NY4 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cnnm3Q32NY4 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cnnm3Q32NY4 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cnnm3Q32NY4 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Cnnm3Q32NY4 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Cnnm3Q32NY4 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Cnnm3Q32NY4 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Cnnm3Q32NY4 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Cnnm3Q32NY4 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Cnnm3Q32NY4 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Cnnm3Q32NY4 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Cnnm3Q32NY4 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Cnnm3Q32NY4 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Cnnm3Q32NY4 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Cnnm3Q32NY4 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Cnnm3Q32NY4 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cnnm3Q32NY4 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cnnm3Q32NY4 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cnnm3Q32NY4 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cnnm3Q32NY4 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cnnm3Q32NY4 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cnnm3Q32NY4 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cnnm3Q32NY4 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cnnm3Q32NY4 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cnnm3Q32NY4 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cnnm3Q32NY4 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cnnm3Q32NY4 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cnnm3Q32NY4 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cnnm3Q32NY4 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cnnm3Q32NY4 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Cnnm3Q32NY4 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Cnnm3Q32NY4 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Cnnm3Q32NY4 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Cnnm3Q32NY4 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cnnm3Q32NY4 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cnnm3Q32NY4 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cnnm3Q32NY4 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cnnm3Q32NY4 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cnnm3Q32NY4 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cnnm3Q32NY4 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Cnnm3Q32NY4 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Cnnm3Q32NY4 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Cnnm3Q32NY4 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Cnnm3Q32NY4 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
Cnnm3Q32NY4 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Cnnm3Q32NY4 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cnnm3Q32NY4 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cnnm3Q32NY4 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cnnm3Q32NY4 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cnnm3Q32NY4 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cnnm3Q32NY4 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Cnnm3Q32NY4 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Cnnm3Q32NY4 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cnnm3Q32NY4 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cnnm3Q32NY4 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cnnm3Q32NY4 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cnnm3Q32NY4 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cnnm3Q32NY4 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cnnm3Q32NY4 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cnnm3Q32NY4 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cnnm3Q32NY4 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Cnnm3Q32NY4 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Cnnm3Q32NY4 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Cnnm3Q32NY4 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Cnnm3Q32NY4 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Cnnm3Q32NY4 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Cnnm3Q32NY4 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Cnnm3Q32NY4 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Cnnm3Q32NY4 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Cnnm3Q32NY4 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Cnnm3Q32NY4 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Cnnm3Q32NY4 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Cnnm3Q32NY4 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Cnnm3Q32NY4 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Cnnm3Q32NY4 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Cnnm3Q32NY4 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Cnnm3Q32NY4 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Cnnm3Q32NY4 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Cnnm3Q32NY4 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Cnnm3Q32NY4 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cnnm3Q32NY4 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cnnm3Q32NY4 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms