Protein–RNA interactions for Protein: Q14AI6

Rpusd3, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Rpusd3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd3Q14AI6 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rpusd3Q14AI6 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rpusd3Q14AI6 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rpusd3Q14AI6 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rpusd3Q14AI6 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rpusd3Q14AI6 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rpusd3Q14AI6 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rpusd3Q14AI6 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rpusd3Q14AI6 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rpusd3Q14AI6 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rpusd3Q14AI6 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rpusd3Q14AI6 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rpusd3Q14AI6 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rpusd3Q14AI6 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rpusd3Q14AI6 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rpusd3Q14AI6 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rpusd3Q14AI6 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rpusd3Q14AI6 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rpusd3Q14AI6 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rpusd3Q14AI6 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rpusd3Q14AI6 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rpusd3Q14AI6 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rpusd3Q14AI6 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rpusd3Q14AI6 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rpusd3Q14AI6 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rpusd3Q14AI6 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rpusd3Q14AI6 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rpusd3Q14AI6 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rpusd3Q14AI6 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rpusd3Q14AI6 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rpusd3Q14AI6 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rpusd3Q14AI6 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rpusd3Q14AI6 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rpusd3Q14AI6 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rpusd3Q14AI6 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Rpusd3Q14AI6 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rpusd3Q14AI6 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rpusd3Q14AI6 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rpusd3Q14AI6 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rpusd3Q14AI6 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rpusd3Q14AI6 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rpusd3Q14AI6 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rpusd3Q14AI6 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rpusd3Q14AI6 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Rpusd3Q14AI6 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rpusd3Q14AI6 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rpusd3Q14AI6 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rpusd3Q14AI6 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rpusd3Q14AI6 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rpusd3Q14AI6 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rpusd3Q14AI6 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Rpusd3Q14AI6 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rpusd3Q14AI6 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rpusd3Q14AI6 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rpusd3Q14AI6 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rpusd3Q14AI6 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rpusd3Q14AI6 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rpusd3Q14AI6 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rpusd3Q14AI6 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rpusd3Q14AI6 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rpusd3Q14AI6 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Rpusd3Q14AI6 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
Rpusd3Q14AI6 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rpusd3Q14AI6 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rpusd3Q14AI6 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rpusd3Q14AI6 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rpusd3Q14AI6 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rpusd3Q14AI6 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rpusd3Q14AI6 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rpusd3Q14AI6 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rpusd3Q14AI6 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rpusd3Q14AI6 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rpusd3Q14AI6 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rpusd3Q14AI6 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rpusd3Q14AI6 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rpusd3Q14AI6 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rpusd3Q14AI6 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rpusd3Q14AI6 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rpusd3Q14AI6 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rpusd3Q14AI6 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rpusd3Q14AI6 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rpusd3Q14AI6 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rpusd3Q14AI6 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rpusd3Q14AI6 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rpusd3Q14AI6 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rpusd3Q14AI6 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rpusd3Q14AI6 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rpusd3Q14AI6 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rpusd3Q14AI6 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rpusd3Q14AI6 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rpusd3Q14AI6 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rpusd3Q14AI6 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rpusd3Q14AI6 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rpusd3Q14AI6 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Rpusd3Q14AI6 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Rpusd3Q14AI6 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rpusd3Q14AI6 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rpusd3Q14AI6 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rpusd3Q14AI6 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rpusd3Q14AI6 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms