Protein–RNA interactions for Protein: Q12417

PRP46, Pre-mRNA-splicing factor PRP46, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 451 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PRP46Q12417 ECM27YJR106W 2178 nt6.98□□□□□ -1.29
PRP46Q12417 INO1YJL153C 1602 nt6.98□□□□□ -1.29
PRP46Q12417 WSC4YHL028W 1818 nt6.97□□□□□ -1.29
PRP46Q12417 GCD11YER025W 1584 nt6.97□□□□□ -1.29
PRP46Q12417 RRT6YGL146C 936 nt6.97□□□□□ -1.29
PRP46Q12417 YGR137WYGR137W 375 nt6.97□□□□□ -1.29
PRP46Q12417 APT1YML022W 564 nt6.97□□□□□ -1.29
PRP46Q12417 YEL023CYEL023C 2049 nt6.96□□□□□ -1.3
PRP46Q12417 PNS1YOR161C 1620 nt6.95□□□□□ -1.3
PRP46Q12417 ARO3YDR035W 1113 nt6.95□□□□□ -1.3
PRP46Q12417 CPR2YHR057C 618 nt6.95□□□□□ -1.3
PRP46Q12417 MAM3YOL060C 2121 nt6.95□□□□□ -1.3
PRP46Q12417 TIF3YPR163C 1311 nt6.95□□□□□ -1.3
PRP46Q12417 INM1YHR046C 888 nt6.94□□□□□ -1.3
PRP46Q12417 BAP3YDR046C 1815 nt6.94□□□□□ -1.3
PRP46Q12417 CBK1YNL161W 2271 nt6.93□□□□□ -1.3
PRP46Q12417 MRN1YPL184C 1839 nt6.93□□□□□ -1.3
PRP46Q12417 MGM101YJR144W 810 nt6.92□□□□□ -1.3
PRP46Q12417 tD(GUC)BtD(GUC)B 72 nt6.91□□□□□ -1.3
PRP46Q12417 tD(GUC)DtD(GUC)D 72 nt6.91□□□□□ -1.3
PRP46Q12417 tD(GUC)G1tD(GUC)G1 72 nt6.91□□□□□ -1.3
PRP46Q12417 tD(GUC)G2tD(GUC)G2 72 nt6.91□□□□□ -1.3
PRP46Q12417 tD(GUC)I1tD(GUC)I1 72 nt6.91□□□□□ -1.3
PRP46Q12417 tD(GUC)I2tD(GUC)I2 72 nt6.91□□□□□ -1.3
PRP46Q12417 tD(GUC)J1tD(GUC)J1 72 nt6.91□□□□□ -1.3
PRP46Q12417 tD(GUC)J2tD(GUC)J2 72 nt6.91□□□□□ -1.3
PRP46Q12417 tD(GUC)J3tD(GUC)J3 72 nt6.91□□□□□ -1.3
PRP46Q12417 tD(GUC)J4tD(GUC)J4 72 nt6.91□□□□□ -1.3
PRP46Q12417 tD(GUC)KtD(GUC)K 72 nt6.91□□□□□ -1.3
PRP46Q12417 tD(GUC)L1tD(GUC)L1 72 nt6.91□□□□□ -1.3
PRP46Q12417 tD(GUC)L2tD(GUC)L2 72 nt6.91□□□□□ -1.3
PRP46Q12417 tD(GUC)MtD(GUC)M 72 nt6.91□□□□□ -1.3
PRP46Q12417 tD(GUC)OtD(GUC)O 72 nt6.91□□□□□ -1.3
PRP46Q12417 YNL140CYNL140C 570 nt6.91□□□□□ -1.3
PRP46Q12417 PRE5YMR314W 705 nt6.9□□□□□ -1.3
PRP46Q12417 CRN1YLR429W 1956 nt6.89□□□□□ -1.31
PRP46Q12417 DUR3YHL016C 2208 nt6.89□□□□□ -1.31
PRP46Q12417 UFD1YGR048W 1086 nt6.89□□□□□ -1.31
PRP46Q12417 MRP7YNL005C 1116 nt6.89□□□□□ -1.31
PRP46Q12417 HBS1YKR084C 1836 nt6.88□□□□□ -1.31
PRP46Q12417 FTH1YBR207W 1398 nt6.87□□□□□ -1.31
PRP46Q12417 SNP1YIL061C 903 nt6.87□□□□□ -1.31
PRP46Q12417 ORT1YOR130C 879 nt6.87□□□□□ -1.31
PRP46Q12417 MLS1YNL117W 1665 nt6.87□□□□□ -1.31
PRP46Q12417 STE3YKL178C 1413 nt6.86□□□□□ -1.31
PRP46Q12417 HOG1YLR113W 1308 nt6.86□□□□□ -1.31
PRP46Q12417 STF1YDL130W-A 261 nt6.86□□□□□ -1.31
PRP46Q12417 NAS6YGR232W 687 nt6.86□□□□□ -1.31
PRP46Q12417 YLR358CYLR358C 564 nt6.86□□□□□ -1.31
PRP46Q12417 RRP43YCR035C 1185 nt6.85□□□□□ -1.31
PRP46Q12417 PIH1YHR034C 1035 nt6.85□□□□□ -1.31
PRP46Q12417 MIM1YOL026C 342 nt6.85□□□□□ -1.31
PRP46Q12417 DST1YGL043W 930 nt6.84□□□□□ -1.31
PRP46Q12417 ERV2YPR037C 591 nt6.84□□□□□ -1.31
PRP46Q12417 KTR4YBR199W 1395 nt6.83□□□□□ -1.32
PRP46Q12417 FIT1YDR534C 1587 nt6.83□□□□□ -1.32
PRP46Q12417 LPD1YFL018C 1500 nt6.83□□□□□ -1.32
PRP46Q12417 MNN9YPL050C 1188 nt6.83□□□□□ -1.32
PRP46Q12417 YNL295WYNL295W 1575 nt6.82□□□□□ -1.32
PRP46Q12417 NCA3YJL116C 1014 nt6.82□□□□□ -1.32
PRP46Q12417 TES1YJR019C 1050 nt6.82□□□□□ -1.32
PRP46Q12417 RPR1RPR1 369 nt6.82□□□□□ -1.32
PRP46Q12417 ELP6YMR312W 822 nt6.82□□□□□ -1.32
PRP46Q12417 YPL247CYPL247C 1572 nt6.81□□□□□ -1.32
PRP46Q12417 DIA4YHR011W 1341 nt6.8□□□□□ -1.32
PRP46Q12417 PUP2YGR253C 783 nt6.8□□□□□ -1.32
PRP46Q12417 ATP23YNR020C 813 nt6.8□□□□□ -1.32
PRP46Q12417 STS1YIR011C 960 nt6.79□□□□□ -1.32
PRP46Q12417 YJR142WYJR142W 1029 nt6.79□□□□□ -1.32
PRP46Q12417 CDA1YLR307W 906 nt6.79□□□□□ -1.32
PRP46Q12417 INP54YOL065C 1155 nt6.79□□□□□ -1.32
PRP46Q12417 MSI1YBR195C 1269 nt6.79□□□□□ -1.32
PRP46Q12417 DOC1YGL240W 753 nt6.78□□□□□ -1.32
PRP46Q12417 NMA2YGR010W 1188 nt6.78□□□□□ -1.32
PRP46Q12417 GUT1YHL032C 2130 nt6.78□□□□□ -1.32
PRP46Q12417 AOS1YPR180W 1044 nt6.78□□□□□ -1.32
PRP46Q12417 SDH8YBR269C 417 nt6.78□□□□□ -1.32
PRP46Q12417 RPL2AYFR031C-A 765 nt6.77□□□□□ -1.33
PRP46Q12417 YHR033WYHR033W 1272 nt6.77□□□□□ -1.33
PRP46Q12417 HRB1YNL004W 1365 nt6.77□□□□□ -1.33
PRP46Q12417 MTC6YHR151C 1581 nt6.77□□□□□ -1.33
PRP46Q12417 UBP13YBL067C 2244 nt6.77□□□□□ -1.33
PRP46Q12417 ALR1YOL130W 2580 nt6.76□□□□□ -1.33
PRP46Q12417 YML079WYML079W 606 nt6.76□□□□□ -1.33
PRP46Q12417 ADH6YMR318C 1083 nt6.76□□□□□ -1.33
PRP46Q12417 TPO1YLL028W 1761 nt6.75□□□□□ -1.33
PRP46Q12417 PSA1YDL055C 1086 nt6.75□□□□□ -1.33
PRP46Q12417 SPS1YDR523C 1473 nt6.74□□□□□ -1.33
PRP46Q12417 SLM3YDL033C 1254 nt6.74□□□□□ -1.33
PRP46Q12417 HAM1YJR069C 594 nt6.74□□□□□ -1.33
PRP46Q12417 ECM10YEL030W 1935 nt6.74□□□□□ -1.33
PRP46Q12417 YDR215CYDR215C 414 nt6.73□□□□□ -1.33
PRP46Q12417 YGL081WYGL081W 963 nt6.73□□□□□ -1.33
PRP46Q12417 PMT1YDL095W 2454 nt6.73□□□□□ -1.33
PRP46Q12417 PEX28YHR150W 1740 nt6.73□□□□□ -1.33
PRP46Q12417 PTH2YBL057C 627 nt6.72□□□□□ -1.33
PRP46Q12417 snR4snR4 186 nt6.72□□□□□ -1.33
PRP46Q12417 CDC3YLR314C 1563 nt6.71□□□□□ -1.34
PRP46Q12417 LAT1YNL071W 1449 nt6.71□□□□□ -1.34
PRP46Q12417 GET2YER083C 858 nt6.71□□□□□ -1.34
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