Protein–RNA interactions for Protein: Q07475

Nrep, Neuronal regeneration-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 68 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrepQ07475 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NrepQ07475 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NrepQ07475 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
NrepQ07475 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NrepQ07475 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NrepQ07475 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NrepQ07475 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NrepQ07475 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NrepQ07475 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NrepQ07475 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NrepQ07475 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NrepQ07475 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NrepQ07475 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NrepQ07475 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NrepQ07475 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NrepQ07475 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NrepQ07475 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NrepQ07475 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NrepQ07475 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NrepQ07475 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
NrepQ07475 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NrepQ07475 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NrepQ07475 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NrepQ07475 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NrepQ07475 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NrepQ07475 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NrepQ07475 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NrepQ07475 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NrepQ07475 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NrepQ07475 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NrepQ07475 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NrepQ07475 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NrepQ07475 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NrepQ07475 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NrepQ07475 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NrepQ07475 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NrepQ07475 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NrepQ07475 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NrepQ07475 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NrepQ07475 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
NrepQ07475 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NrepQ07475 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NrepQ07475 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NrepQ07475 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NrepQ07475 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NrepQ07475 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NrepQ07475 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NrepQ07475 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NrepQ07475 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NrepQ07475 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NrepQ07475 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NrepQ07475 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NrepQ07475 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NrepQ07475 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NrepQ07475 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NrepQ07475 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NrepQ07475 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NrepQ07475 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NrepQ07475 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NrepQ07475 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NrepQ07475 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NrepQ07475 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NrepQ07475 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NrepQ07475 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NrepQ07475 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NrepQ07475 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NrepQ07475 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NrepQ07475 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NrepQ07475 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NrepQ07475 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NrepQ07475 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NrepQ07475 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NrepQ07475 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NrepQ07475 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NrepQ07475 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NrepQ07475 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NrepQ07475 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NrepQ07475 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NrepQ07475 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NrepQ07475 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NrepQ07475 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NrepQ07475 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NrepQ07475 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NrepQ07475 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NrepQ07475 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NrepQ07475 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NrepQ07475 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NrepQ07475 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NrepQ07475 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NrepQ07475 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NrepQ07475 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NrepQ07475 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NrepQ07475 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NrepQ07475 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NrepQ07475 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NrepQ07475 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NrepQ07475 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NrepQ07475 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NrepQ07475 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NrepQ07475 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 160.6 ms