Protein–RNA interactions for Protein: Q05020

Apoc2, Apolipoprotein C-II, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc2Q05020 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Apoc2Q05020 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Apoc2Q05020 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Apoc2Q05020 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Apoc2Q05020 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Apoc2Q05020 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Apoc2Q05020 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Apoc2Q05020 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Apoc2Q05020 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Apoc2Q05020 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Apoc2Q05020 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Apoc2Q05020 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Apoc2Q05020 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Apoc2Q05020 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Apoc2Q05020 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Apoc2Q05020 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Apoc2Q05020 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Apoc2Q05020 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Apoc2Q05020 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Apoc2Q05020 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Apoc2Q05020 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Apoc2Q05020 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Apoc2Q05020 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Apoc2Q05020 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Apoc2Q05020 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Apoc2Q05020 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Apoc2Q05020 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Apoc2Q05020 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Apoc2Q05020 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Apoc2Q05020 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Apoc2Q05020 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Apoc2Q05020 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Apoc2Q05020 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Apoc2Q05020 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Apoc2Q05020 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Apoc2Q05020 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Apoc2Q05020 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Apoc2Q05020 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Apoc2Q05020 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Apoc2Q05020 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Apoc2Q05020 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Apoc2Q05020 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Apoc2Q05020 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Apoc2Q05020 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Apoc2Q05020 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Apoc2Q05020 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Apoc2Q05020 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Apoc2Q05020 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Apoc2Q05020 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Apoc2Q05020 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Apoc2Q05020 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Apoc2Q05020 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Apoc2Q05020 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Apoc2Q05020 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Apoc2Q05020 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Apoc2Q05020 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Apoc2Q05020 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Apoc2Q05020 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Apoc2Q05020 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Apoc2Q05020 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Apoc2Q05020 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Apoc2Q05020 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Apoc2Q05020 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Apoc2Q05020 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Apoc2Q05020 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Apoc2Q05020 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Apoc2Q05020 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Apoc2Q05020 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Apoc2Q05020 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Apoc2Q05020 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Apoc2Q05020 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Apoc2Q05020 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Apoc2Q05020 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Apoc2Q05020 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Apoc2Q05020 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Apoc2Q05020 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Apoc2Q05020 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Apoc2Q05020 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Apoc2Q05020 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Apoc2Q05020 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Apoc2Q05020 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Apoc2Q05020 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Apoc2Q05020 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Apoc2Q05020 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Apoc2Q05020 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Apoc2Q05020 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Apoc2Q05020 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Apoc2Q05020 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Apoc2Q05020 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Apoc2Q05020 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Apoc2Q05020 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Apoc2Q05020 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Apoc2Q05020 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Apoc2Q05020 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Apoc2Q05020 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Apoc2Q05020 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Apoc2Q05020 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Apoc2Q05020 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Apoc2Q05020 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Apoc2Q05020 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms