Protein–RNA interactions for Protein: P62892

Rpl39, 60S ribosomal protein L39, mousemouse

Predictions only

Length 51 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl39P62892 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpl39P62892 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpl39P62892 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpl39P62892 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpl39P62892 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpl39P62892 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpl39P62892 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpl39P62892 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpl39P62892 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpl39P62892 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpl39P62892 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpl39P62892 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpl39P62892 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpl39P62892 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpl39P62892 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpl39P62892 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpl39P62892 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpl39P62892 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpl39P62892 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpl39P62892 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpl39P62892 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpl39P62892 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpl39P62892 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpl39P62892 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpl39P62892 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpl39P62892 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpl39P62892 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpl39P62892 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpl39P62892 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpl39P62892 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpl39P62892 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpl39P62892 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpl39P62892 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpl39P62892 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpl39P62892 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpl39P62892 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpl39P62892 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpl39P62892 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpl39P62892 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpl39P62892 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpl39P62892 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpl39P62892 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpl39P62892 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpl39P62892 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rpl39P62892 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpl39P62892 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpl39P62892 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpl39P62892 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpl39P62892 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpl39P62892 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpl39P62892 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpl39P62892 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpl39P62892 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpl39P62892 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpl39P62892 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpl39P62892 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpl39P62892 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpl39P62892 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpl39P62892 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpl39P62892 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpl39P62892 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpl39P62892 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpl39P62892 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpl39P62892 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpl39P62892 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpl39P62892 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpl39P62892 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpl39P62892 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpl39P62892 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpl39P62892 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpl39P62892 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpl39P62892 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpl39P62892 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpl39P62892 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpl39P62892 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpl39P62892 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Rpl39P62892 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpl39P62892 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpl39P62892 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpl39P62892 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpl39P62892 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpl39P62892 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpl39P62892 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpl39P62892 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpl39P62892 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpl39P62892 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpl39P62892 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpl39P62892 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpl39P62892 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpl39P62892 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpl39P62892 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpl39P62892 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpl39P62892 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpl39P62892 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpl39P62892 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpl39P62892 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpl39P62892 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpl39P62892 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpl39P62892 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpl39P62892 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms