Protein–RNA interactions for Protein: P58281

Opa1, Dynamin-like 120 kDa protein, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opa1P58281 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Opa1P58281 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Opa1P58281 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Opa1P58281 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Opa1P58281 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Opa1P58281 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Opa1P58281 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Opa1P58281 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Opa1P58281 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Opa1P58281 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Opa1P58281 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Opa1P58281 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Opa1P58281 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Opa1P58281 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Opa1P58281 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Opa1P58281 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Opa1P58281 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Opa1P58281 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Opa1P58281 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Opa1P58281 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Opa1P58281 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Opa1P58281 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Opa1P58281 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Opa1P58281 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Opa1P58281 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Opa1P58281 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Opa1P58281 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Opa1P58281 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Opa1P58281 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Opa1P58281 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Opa1P58281 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Opa1P58281 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Opa1P58281 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Opa1P58281 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Opa1P58281 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Opa1P58281 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Opa1P58281 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Opa1P58281 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Opa1P58281 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Opa1P58281 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Opa1P58281 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Opa1P58281 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Opa1P58281 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Opa1P58281 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Opa1P58281 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Opa1P58281 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Opa1P58281 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Opa1P58281 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Opa1P58281 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Opa1P58281 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Opa1P58281 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Opa1P58281 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Opa1P58281 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Opa1P58281 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Opa1P58281 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Opa1P58281 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Opa1P58281 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Opa1P58281 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Opa1P58281 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Opa1P58281 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Opa1P58281 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Opa1P58281 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Opa1P58281 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Opa1P58281 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Opa1P58281 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Opa1P58281 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Opa1P58281 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Opa1P58281 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Opa1P58281 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Opa1P58281 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Opa1P58281 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Opa1P58281 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Opa1P58281 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Opa1P58281 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Opa1P58281 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Opa1P58281 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Opa1P58281 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Opa1P58281 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Opa1P58281 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Opa1P58281 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Opa1P58281 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Opa1P58281 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Opa1P58281 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Opa1P58281 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Opa1P58281 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Opa1P58281 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Opa1P58281 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Opa1P58281 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Opa1P58281 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Opa1P58281 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Opa1P58281 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Opa1P58281 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Opa1P58281 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Opa1P58281 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Opa1P58281 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Opa1P58281 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Opa1P58281 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Opa1P58281 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Opa1P58281 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Opa1P58281 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms