Protein–RNA interactions for Protein: P56382

Atp5e, ATP synthase subunit epsilon, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 52 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5eP56382 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp5eP56382 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp5eP56382 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp5eP56382 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp5eP56382 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp5eP56382 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp5eP56382 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp5eP56382 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp5eP56382 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp5eP56382 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp5eP56382 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp5eP56382 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp5eP56382 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp5eP56382 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp5eP56382 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp5eP56382 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atp5eP56382 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atp5eP56382 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atp5eP56382 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atp5eP56382 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atp5eP56382 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atp5eP56382 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atp5eP56382 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atp5eP56382 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atp5eP56382 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atp5eP56382 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atp5eP56382 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atp5eP56382 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atp5eP56382 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atp5eP56382 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atp5eP56382 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atp5eP56382 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atp5eP56382 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atp5eP56382 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atp5eP56382 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atp5eP56382 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atp5eP56382 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atp5eP56382 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atp5eP56382 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atp5eP56382 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atp5eP56382 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp5eP56382 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp5eP56382 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp5eP56382 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atp5eP56382 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atp5eP56382 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Atp5eP56382 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atp5eP56382 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp5eP56382 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp5eP56382 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp5eP56382 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp5eP56382 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp5eP56382 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp5eP56382 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Atp5eP56382 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Atp5eP56382 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp5eP56382 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Atp5eP56382 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Atp5eP56382 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Atp5eP56382 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Atp5eP56382 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Atp5eP56382 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atp5eP56382 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atp5eP56382 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Atp5eP56382 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atp5eP56382 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atp5eP56382 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atp5eP56382 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atp5eP56382 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atp5eP56382 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atp5eP56382 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atp5eP56382 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Atp5eP56382 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Atp5eP56382 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Atp5eP56382 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atp5eP56382 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atp5eP56382 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Atp5eP56382 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Atp5eP56382 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Atp5eP56382 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Atp5eP56382 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Atp5eP56382 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Atp5eP56382 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Atp5eP56382 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Atp5eP56382 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Atp5eP56382 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atp5eP56382 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atp5eP56382 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atp5eP56382 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Atp5eP56382 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Atp5eP56382 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Atp5eP56382 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Atp5eP56382 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Atp5eP56382 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Atp5eP56382 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Atp5eP56382 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atp5eP56382 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atp5eP56382 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atp5eP56382 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atp5eP56382 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms