Protein–RNA interactions for Protein: P50608

Fmod, Fibromodulin, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FmodP50608 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
FmodP50608 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
FmodP50608 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
FmodP50608 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
FmodP50608 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FmodP50608 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FmodP50608 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FmodP50608 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FmodP50608 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FmodP50608 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FmodP50608 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FmodP50608 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FmodP50608 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FmodP50608 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FmodP50608 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FmodP50608 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FmodP50608 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FmodP50608 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FmodP50608 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FmodP50608 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FmodP50608 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
FmodP50608 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FmodP50608 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FmodP50608 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FmodP50608 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FmodP50608 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FmodP50608 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
FmodP50608 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FmodP50608 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FmodP50608 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
FmodP50608 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FmodP50608 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FmodP50608 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FmodP50608 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FmodP50608 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FmodP50608 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FmodP50608 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FmodP50608 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
FmodP50608 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
FmodP50608 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FmodP50608 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
FmodP50608 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
FmodP50608 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
FmodP50608 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
FmodP50608 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
FmodP50608 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
FmodP50608 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
FmodP50608 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
FmodP50608 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
FmodP50608 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
FmodP50608 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
FmodP50608 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
FmodP50608 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
FmodP50608 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
FmodP50608 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
FmodP50608 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
FmodP50608 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
FmodP50608 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
FmodP50608 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
FmodP50608 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
FmodP50608 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
FmodP50608 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
FmodP50608 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
FmodP50608 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
FmodP50608 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
FmodP50608 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
FmodP50608 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
FmodP50608 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
FmodP50608 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FmodP50608 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FmodP50608 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FmodP50608 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FmodP50608 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FmodP50608 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FmodP50608 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FmodP50608 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FmodP50608 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FmodP50608 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FmodP50608 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FmodP50608 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FmodP50608 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FmodP50608 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FmodP50608 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FmodP50608 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FmodP50608 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
FmodP50608 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
FmodP50608 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
FmodP50608 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
FmodP50608 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
FmodP50608 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
FmodP50608 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
FmodP50608 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
FmodP50608 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
FmodP50608 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
FmodP50608 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
FmodP50608 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FmodP50608 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FmodP50608 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FmodP50608 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FmodP50608 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms