Protein–RNA interactions for Protein: P48410

Abcd1, ATP-binding cassette sub-family D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd1P48410 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25,59■■□□□ 1,69
Abcd1P48410 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,59■■□□□ 1,69
Abcd1P48410 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,59■■□□□ 1,69
Abcd1P48410 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,59■■□□□ 1,69
Abcd1P48410 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,58■■□□□ 1,69
Abcd1P48410 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25,58■■□□□ 1,69
Abcd1P48410 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,57■■□□□ 1,68
Abcd1P48410 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,57■■□□□ 1,68
Abcd1P48410 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25,57■■□□□ 1,68
Abcd1P48410 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25,57■■□□□ 1,68
Abcd1P48410 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,57■■□□□ 1,68
Abcd1P48410 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,57■■□□□ 1,68
Abcd1P48410 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,57■■□□□ 1,68
Abcd1P48410 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,56■■□□□ 1,68
Abcd1P48410 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25,56■■□□□ 1,68
Abcd1P48410 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25,56■■□□□ 1,68
Abcd1P48410 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25,55■■□□□ 1,68
Abcd1P48410 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25,55■■□□□ 1,68
Abcd1P48410 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25,55■■□□□ 1,68
Abcd1P48410 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,55■■□□□ 1,68
Abcd1P48410 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25,54■■□□□ 1,68
Abcd1P48410 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,54■■□□□ 1,68
Abcd1P48410 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,54■■□□□ 1,68
Abcd1P48410 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,54■■□□□ 1,68
Abcd1P48410 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25,53■■□□□ 1,68
Abcd1P48410 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,53■■□□□ 1,68
Abcd1P48410 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25,52■■□□□ 1,68
Abcd1P48410 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25,52■■□□□ 1,68
Abcd1P48410 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,51■■□□□ 1,67
Abcd1P48410 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,51■■□□□ 1,67
Abcd1P48410 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25,51■■□□□ 1,67
Abcd1P48410 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,51■■□□□ 1,67
Abcd1P48410 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25,51■■□□□ 1,67
Abcd1P48410 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25,51■■□□□ 1,67
Abcd1P48410 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25,51■■□□□ 1,67
Abcd1P48410 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,51■■□□□ 1,67
Abcd1P48410 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,51■■□□□ 1,67
Abcd1P48410 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,5■■□□□ 1,67
Abcd1P48410 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,5■■□□□ 1,67
Abcd1P48410 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25,5■■□□□ 1,67
Abcd1P48410 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25,5■■□□□ 1,67
Abcd1P48410 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,5■■□□□ 1,67
Abcd1P48410 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,49■■□□□ 1,67
Abcd1P48410 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,49■■□□□ 1,67
Abcd1P48410 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25,49■■□□□ 1,67
Abcd1P48410 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC25,49■■□□□ 1,67
Abcd1P48410 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,49■■□□□ 1,67
Abcd1P48410 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,48■■□□□ 1,67
Abcd1P48410 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,48■■□□□ 1,67
Abcd1P48410 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25,47■■□□□ 1,67
Abcd1P48410 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,47■■□□□ 1,67
Abcd1P48410 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25,47■■□□□ 1,67
Abcd1P48410 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25,47■■□□□ 1,67
Abcd1P48410 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC25,47■■□□□ 1,67
Abcd1P48410 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,47■■□□□ 1,67
Abcd1P48410 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,46■■□□□ 1,67
Abcd1P48410 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,46■■□□□ 1,67
Abcd1P48410 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,46■■□□□ 1,67
Abcd1P48410 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,45■■□□□ 1,67
Abcd1P48410 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC25,45■■□□□ 1,66
Abcd1P48410 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25,45■■□□□ 1,66
Abcd1P48410 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC25,45■■□□□ 1,66
Abcd1P48410 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC25,45■■□□□ 1,66
Abcd1P48410 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25,44■■□□□ 1,66
Abcd1P48410 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,44■■□□□ 1,66
Abcd1P48410 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,44■■□□□ 1,66
Abcd1P48410 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25,44■■□□□ 1,66
Abcd1P48410 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,44■■□□□ 1,66
Abcd1P48410 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,44■■□□□ 1,66
Abcd1P48410 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,43■■□□□ 1,66
Abcd1P48410 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25,43■■□□□ 1,66
Abcd1P48410 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,43■■□□□ 1,66
Abcd1P48410 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,43■■□□□ 1,66
Abcd1P48410 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,43■■□□□ 1,66
Abcd1P48410 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,43■■□□□ 1,66
Abcd1P48410 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,43■■□□□ 1,66
Abcd1P48410 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,42■■□□□ 1,66
Abcd1P48410 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25,42■■□□□ 1,66
Abcd1P48410 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25,42■■□□□ 1,66
Abcd1P48410 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,42■■□□□ 1,66
Abcd1P48410 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC25,41■■□□□ 1,66
Abcd1P48410 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,41■■□□□ 1,66
Abcd1P48410 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,41■■□□□ 1,66
Abcd1P48410 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,41■■□□□ 1,66
Abcd1P48410 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,41■■□□□ 1,66
Abcd1P48410 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25,41■■□□□ 1,66
Abcd1P48410 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,41■■□□□ 1,66
Abcd1P48410 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25,4■■□□□ 1,66
Abcd1P48410 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25,4■■□□□ 1,66
Abcd1P48410 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25,4■■□□□ 1,66
Abcd1P48410 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25,4■■□□□ 1,66
Abcd1P48410 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25,4■■□□□ 1,66
Abcd1P48410 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,4■■□□□ 1,66
Abcd1P48410 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25,38■■□□□ 1,65
Abcd1P48410 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,38■■□□□ 1,65
Abcd1P48410 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25,38■■□□□ 1,65
Abcd1P48410 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC25,38■■□□□ 1,65
Abcd1P48410 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25,38■■□□□ 1,65
Abcd1P48410 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25,37■■□□□ 1,65
Abcd1P48410 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,37■■□□□ 1,65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms