Protein–RNA interactions for Protein: P35918

Kdr, Vascular endothelial growth factor receptor 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KdrP35918 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
KdrP35918 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
KdrP35918 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
KdrP35918 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC32.61■■■□□ 2.81
KdrP35918 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
KdrP35918 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
KdrP35918 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
KdrP35918 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
KdrP35918 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
KdrP35918 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
KdrP35918 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
KdrP35918 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
KdrP35918 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
KdrP35918 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
KdrP35918 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
KdrP35918 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
KdrP35918 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC32.57■■■□□ 2.8
KdrP35918 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC32.56■■■□□ 2.8
KdrP35918 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
KdrP35918 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
KdrP35918 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
KdrP35918 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
KdrP35918 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
KdrP35918 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
KdrP35918 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
KdrP35918 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
KdrP35918 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
KdrP35918 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
KdrP35918 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
KdrP35918 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
KdrP35918 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
KdrP35918 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
KdrP35918 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC32.47■■■□□ 2.79
KdrP35918 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
KdrP35918 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
KdrP35918 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
KdrP35918 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
KdrP35918 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.78
KdrP35918 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
KdrP35918 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC32.44■■■□□ 2.78
KdrP35918 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
KdrP35918 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC32.43■■■□□ 2.78
KdrP35918 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
KdrP35918 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
KdrP35918 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
KdrP35918 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
KdrP35918 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
KdrP35918 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
KdrP35918 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
KdrP35918 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC32.38■■■□□ 2.77
KdrP35918 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
KdrP35918 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
KdrP35918 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
KdrP35918 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC32.36■■■□□ 2.77
KdrP35918 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
KdrP35918 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
KdrP35918 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
KdrP35918 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
KdrP35918 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
KdrP35918 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
KdrP35918 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
KdrP35918 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
KdrP35918 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
KdrP35918 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
KdrP35918 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
KdrP35918 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
KdrP35918 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.77
KdrP35918 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
KdrP35918 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
KdrP35918 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
KdrP35918 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
KdrP35918 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
KdrP35918 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
KdrP35918 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
KdrP35918 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
KdrP35918 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
KdrP35918 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
KdrP35918 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
KdrP35918 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
KdrP35918 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
KdrP35918 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
KdrP35918 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
KdrP35918 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
KdrP35918 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
KdrP35918 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
KdrP35918 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
KdrP35918 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
KdrP35918 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
KdrP35918 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC32.23■■■□□ 2.75
KdrP35918 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
KdrP35918 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
KdrP35918 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
KdrP35918 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
KdrP35918 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
KdrP35918 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
KdrP35918 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
KdrP35918 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
KdrP35918 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
KdrP35918 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
KdrP35918 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms