Protein–RNA interactions for Protein: P26361

Cftr, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CftrP26361 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.28■■■■■ 4.2
CftrP26361 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC41.28■■■■■ 4.2
CftrP26361 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.28■■■■■ 4.2
CftrP26361 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.27■■■■■ 4.2
CftrP26361 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC41.27■■■■■ 4.2
CftrP26361 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.26■■■■■ 4.2
CftrP26361 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.26■■■■■ 4.19
CftrP26361 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.25■■■■■ 4.19
CftrP26361 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.24■■■■■ 4.19
CftrP26361 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.24■■■■■ 4.19
CftrP26361 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC41.24■■■■■ 4.19
CftrP26361 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.23■■■■■ 4.19
CftrP26361 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.22■■■■■ 4.19
CftrP26361 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC41.22■■■■■ 4.19
CftrP26361 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.21■■■■■ 4.19
CftrP26361 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC41.21■■■■■ 4.19
CftrP26361 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC41.21■■■■■ 4.19
CftrP26361 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC41.21■■■■■ 4.19
CftrP26361 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.2■■■■■ 4.19
CftrP26361 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC41.2■■■■■ 4.19
CftrP26361 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC41.2■■■■■ 4.19
CftrP26361 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC41.19■■■■■ 4.18
CftrP26361 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.18■■■■■ 4.18
CftrP26361 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC41.18■■■■■ 4.18
CftrP26361 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.17■■■■■ 4.18
CftrP26361 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC41.17■■■■■ 4.18
CftrP26361 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.17■■■■■ 4.18
CftrP26361 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC41.17■■■■■ 4.18
CftrP26361 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC41.15■■■■■ 4.18
CftrP26361 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.15■■■■■ 4.18
CftrP26361 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.14■■■■■ 4.18
CftrP26361 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.13■■■■■ 4.17
CftrP26361 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC41.12■■■■■ 4.17
CftrP26361 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.12■■■■■ 4.17
CftrP26361 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.12■■■■■ 4.17
CftrP26361 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC41.11■■■■■ 4.17
CftrP26361 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC41.11■■■■■ 4.17
CftrP26361 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.11■■■■■ 4.17
CftrP26361 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.11■■■■■ 4.17
CftrP26361 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.11■■■■■ 4.17
CftrP26361 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.1■■■■■ 4.17
CftrP26361 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.09■■■■■ 4.17
CftrP26361 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.09■■■■■ 4.17
CftrP26361 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.09■■■■■ 4.17
CftrP26361 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC41.08■■■■■ 4.17
CftrP26361 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC41.07■■■■■ 4.16
CftrP26361 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.06■■■■■ 4.16
CftrP26361 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.05■■■■■ 4.16
CftrP26361 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.04■■■■■ 4.16
CftrP26361 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC41.04■■■■■ 4.16
CftrP26361 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.04■■■■■ 4.16
CftrP26361 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.03■■■■■ 4.16
CftrP26361 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC41.02■■■■■ 4.16
CftrP26361 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC41.02■■■■■ 4.16
CftrP26361 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC41.02■■■■■ 4.16
CftrP26361 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.01■■■■■ 4.16
CftrP26361 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC41.01■■■■■ 4.16
CftrP26361 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.01■■■■■ 4.16
CftrP26361 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.01■■■■■ 4.15
CftrP26361 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.01■■■■■ 4.15
CftrP26361 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC41■■■■■ 4.15
CftrP26361 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC41■■■■■ 4.15
CftrP26361 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC41■■■■■ 4.15
CftrP26361 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41■■■■■ 4.15
CftrP26361 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC40.99■■■■■ 4.15
CftrP26361 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC40.99■■■■■ 4.15
CftrP26361 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC40.97■■■■■ 4.15
CftrP26361 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC40.97■■■■■ 4.15
CftrP26361 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.97■■■■■ 4.15
CftrP26361 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.97■■■■■ 4.15
CftrP26361 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC40.96■■■■■ 4.15
CftrP26361 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.96■■■■■ 4.15
CftrP26361 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC40.96■■■■■ 4.15
CftrP26361 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC40.95■■■■■ 4.15
CftrP26361 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.94■■■■■ 4.14
CftrP26361 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC40.94■■■■■ 4.14
CftrP26361 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC40.94■■■■■ 4.14
CftrP26361 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC40.93■■■■■ 4.14
CftrP26361 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC40.93■■■■■ 4.14
CftrP26361 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC40.93■■■■■ 4.14
CftrP26361 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC40.92■■■■■ 4.14
CftrP26361 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC40.92■■■■■ 4.14
CftrP26361 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC40.92■■■■■ 4.14
CftrP26361 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.92■■■■■ 4.14
CftrP26361 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.88■■■■■ 4.13
CftrP26361 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC40.87■■■■■ 4.13
CftrP26361 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.86■■■■■ 4.13
CftrP26361 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC40.86■■■■■ 4.13
CftrP26361 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.86■■■■■ 4.13
CftrP26361 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.85■■■■■ 4.13
CftrP26361 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC40.84■■■■■ 4.13
CftrP26361 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC40.83■■■■■ 4.13
CftrP26361 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC40.83■■■■■ 4.13
CftrP26361 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC40.83■■■■■ 4.13
CftrP26361 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC40.83■■■■■ 4.13
CftrP26361 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC40.83■■■■■ 4.13
CftrP26361 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC40.82■■■■■ 4.12
CftrP26361 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC40.81■■■■■ 4.12
CftrP26361 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC40.81■■■■■ 4.12
CftrP26361 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.81■■■■■ 4.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 103.7 ms