Protein–RNA interactions for Protein: P18530

Ig heavy chain V region 7-39, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18530 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
P18530 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
P18530 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
P18530 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
P18530 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
P18530 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
P18530 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
P18530 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
P18530 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
P18530 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
P18530 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
P18530 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
P18530 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
P18530 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
P18530 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
P18530 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
P18530 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
P18530 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
P18530 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
P18530 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
P18530 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
P18530 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
P18530 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
P18530 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
P18530 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
P18530 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
P18530 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
P18530 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
P18530 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
P18530 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
P18530 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
P18530 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
P18530 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
P18530 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
P18530 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
P18530 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
P18530 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
P18530 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
P18530 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
P18530 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
P18530 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
P18530 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
P18530 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
P18530 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
P18530 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
P18530 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
P18530 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.58
P18530 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
P18530 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
P18530 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
P18530 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
P18530 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
P18530 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
P18530 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
P18530 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
P18530 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
P18530 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
P18530 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
P18530 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
P18530 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
P18530 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
P18530 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
P18530 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
P18530 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
P18530 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
P18530 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
P18530 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
P18530 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
P18530 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
P18530 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
P18530 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
P18530 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
P18530 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
P18530 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
P18530 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
P18530 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
P18530 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
P18530 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
P18530 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
P18530 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
P18530 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
P18530 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
P18530 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
P18530 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
P18530 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
P18530 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
P18530 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
P18530 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
P18530 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
P18530 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
P18530 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
P18530 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
P18530 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
P18530 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
P18530 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
P18530 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
P18530 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
P18530 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
P18530 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
P18530 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms