Protein–RNA interactions for Protein: P11679

Krt8, Keratin, type II cytoskeletal 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt8P11679 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Krt8P11679 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Krt8P11679 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Krt8P11679 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Krt8P11679 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Krt8P11679 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Krt8P11679 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Krt8P11679 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Krt8P11679 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Krt8P11679 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Krt8P11679 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Krt8P11679 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Krt8P11679 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Krt8P11679 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Krt8P11679 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Krt8P11679 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Krt8P11679 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Krt8P11679 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Krt8P11679 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Krt8P11679 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Krt8P11679 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Krt8P11679 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Krt8P11679 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Krt8P11679 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Krt8P11679 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Krt8P11679 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Krt8P11679 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Krt8P11679 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Krt8P11679 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Krt8P11679 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Krt8P11679 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Krt8P11679 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Krt8P11679 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Krt8P11679 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Krt8P11679 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Krt8P11679 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Krt8P11679 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Krt8P11679 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Krt8P11679 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Krt8P11679 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Krt8P11679 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Krt8P11679 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Krt8P11679 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Krt8P11679 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Krt8P11679 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Krt8P11679 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Krt8P11679 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Krt8P11679 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Krt8P11679 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Krt8P11679 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Krt8P11679 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Krt8P11679 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Krt8P11679 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Krt8P11679 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Krt8P11679 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Krt8P11679 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Krt8P11679 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Krt8P11679 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Krt8P11679 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Krt8P11679 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Krt8P11679 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Krt8P11679 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Krt8P11679 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Krt8P11679 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Krt8P11679 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Krt8P11679 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Krt8P11679 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Krt8P11679 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Krt8P11679 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Krt8P11679 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Krt8P11679 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Krt8P11679 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Krt8P11679 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Krt8P11679 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Krt8P11679 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Krt8P11679 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Krt8P11679 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Krt8P11679 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Krt8P11679 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Krt8P11679 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Krt8P11679 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Krt8P11679 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Krt8P11679 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Krt8P11679 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Krt8P11679 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Krt8P11679 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Krt8P11679 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Krt8P11679 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Krt8P11679 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Krt8P11679 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Krt8P11679 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Krt8P11679 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Krt8P11679 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Krt8P11679 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Krt8P11679 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Krt8P11679 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Krt8P11679 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Krt8P11679 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Krt8P11679 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Krt8P11679 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.9 ms