Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
P10404 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
P10404 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
P10404 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
P10404 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
P10404 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
P10404 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
P10404 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
P10404 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
P10404 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
P10404 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
P10404 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
P10404 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
P10404 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
P10404 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
P10404 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
P10404 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
P10404 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
P10404 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
P10404 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
P10404 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
P10404 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
P10404 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
P10404 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
P10404 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
P10404 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
P10404 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
P10404 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
P10404 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
P10404 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
P10404 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
P10404 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
P10404 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
P10404 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
P10404 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
P10404 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
P10404 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
P10404 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
P10404 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
P10404 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
P10404 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
P10404 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
P10404 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
P10404 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
P10404 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
P10404 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
P10404 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
P10404 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
P10404 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
P10404 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
P10404 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
P10404 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
P10404 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
P10404 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
P10404 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
P10404 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
P10404 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
P10404 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
P10404 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
P10404 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
P10404 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
P10404 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
P10404 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
P10404 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
P10404 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
P10404 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
P10404 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
P10404 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
P10404 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
P10404 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
P10404 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
P10404 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
P10404 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
P10404 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
P10404 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
P10404 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
P10404 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
P10404 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
P10404 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
P10404 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
P10404 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
P10404 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
P10404 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
P10404 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
P10404 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
P10404 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
P10404 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
P10404 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
P10404 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
P10404 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
P10404 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
P10404 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
P10404 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
P10404 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
P10404 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
P10404 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
P10404 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
P10404 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
P10404 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
P10404 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
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