Protein–RNA interactions for Protein: P0DP71

FAM236C, Protein FAM236C, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM236CP0DP71 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM236CP0DP71 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM236CP0DP71 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM236CP0DP71 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM236CP0DP71 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM236CP0DP71 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM236CP0DP71 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM236CP0DP71 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM236CP0DP71 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM236CP0DP71 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM236CP0DP71 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM236CP0DP71 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM236CP0DP71 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM236CP0DP71 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM236CP0DP71 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM236CP0DP71 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM236CP0DP71 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM236CP0DP71 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM236CP0DP71 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM236CP0DP71 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM236CP0DP71 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM236CP0DP71 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM236CP0DP71 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM236CP0DP71 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM236CP0DP71 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM236CP0DP71 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM236CP0DP71 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM236CP0DP71 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM236CP0DP71 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM236CP0DP71 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM236CP0DP71 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM236CP0DP71 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM236CP0DP71 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM236CP0DP71 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM236CP0DP71 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM236CP0DP71 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM236CP0DP71 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM236CP0DP71 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM236CP0DP71 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM236CP0DP71 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM236CP0DP71 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM236CP0DP71 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM236CP0DP71 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM236CP0DP71 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM236CP0DP71 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM236CP0DP71 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM236CP0DP71 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM236CP0DP71 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM236CP0DP71 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM236CP0DP71 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM236CP0DP71 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM236CP0DP71 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM236CP0DP71 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM236CP0DP71 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM236CP0DP71 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM236CP0DP71 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM236CP0DP71 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM236CP0DP71 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM236CP0DP71 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM236CP0DP71 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM236CP0DP71 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM236CP0DP71 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM236CP0DP71 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM236CP0DP71 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM236CP0DP71 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM236CP0DP71 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM236CP0DP71 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM236CP0DP71 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM236CP0DP71 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM236CP0DP71 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM236CP0DP71 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM236CP0DP71 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM236CP0DP71 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM236CP0DP71 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM236CP0DP71 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM236CP0DP71 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
FAM236CP0DP71 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
FAM236CP0DP71 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM236CP0DP71 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
FAM236CP0DP71 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM236CP0DP71 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM236CP0DP71 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM236CP0DP71 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
FAM236CP0DP71 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM236CP0DP71 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM236CP0DP71 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
FAM236CP0DP71 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM236CP0DP71 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
FAM236CP0DP71 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FAM236CP0DP71 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FAM236CP0DP71 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
FAM236CP0DP71 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
FAM236CP0DP71 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
FAM236CP0DP71 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
FAM236CP0DP71 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
FAM236CP0DP71 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FAM236CP0DP71 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
FAM236CP0DP71 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FAM236CP0DP71 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
FAM236CP0DP71 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms