Protein–RNA interactions for Protein: P07744

Krt4, Keratin, type II cytoskeletal 4, mousemouse

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt4P07744 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Krt4P07744 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Krt4P07744 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Krt4P07744 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Krt4P07744 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Krt4P07744 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Krt4P07744 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Krt4P07744 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Krt4P07744 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Krt4P07744 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Krt4P07744 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Krt4P07744 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Krt4P07744 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Krt4P07744 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Krt4P07744 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Krt4P07744 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Krt4P07744 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Krt4P07744 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Krt4P07744 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Krt4P07744 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Krt4P07744 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Krt4P07744 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Krt4P07744 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Krt4P07744 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Krt4P07744 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Krt4P07744 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Krt4P07744 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Krt4P07744 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Krt4P07744 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Krt4P07744 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Krt4P07744 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Krt4P07744 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Krt4P07744 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Krt4P07744 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Krt4P07744 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Krt4P07744 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Krt4P07744 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Krt4P07744 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Krt4P07744 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Krt4P07744 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Krt4P07744 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Krt4P07744 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Krt4P07744 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Krt4P07744 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Krt4P07744 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Krt4P07744 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Krt4P07744 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Krt4P07744 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Krt4P07744 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Krt4P07744 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Krt4P07744 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Krt4P07744 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Krt4P07744 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Krt4P07744 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Krt4P07744 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Krt4P07744 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Krt4P07744 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Krt4P07744 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Krt4P07744 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Krt4P07744 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Krt4P07744 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Krt4P07744 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Krt4P07744 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Krt4P07744 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Krt4P07744 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Krt4P07744 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Krt4P07744 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Krt4P07744 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Krt4P07744 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Krt4P07744 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Krt4P07744 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Krt4P07744 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Krt4P07744 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Krt4P07744 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Krt4P07744 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Krt4P07744 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Krt4P07744 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Krt4P07744 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Krt4P07744 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Krt4P07744 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Krt4P07744 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Krt4P07744 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Krt4P07744 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Krt4P07744 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Krt4P07744 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Krt4P07744 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Krt4P07744 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Krt4P07744 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Krt4P07744 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Krt4P07744 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Krt4P07744 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Krt4P07744 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Krt4P07744 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Krt4P07744 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Krt4P07744 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Krt4P07744 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Krt4P07744 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Krt4P07744 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Krt4P07744 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Krt4P07744 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59 ms