Protein–RNA interactions for Protein: P07349

Ifna5, Interferon alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna5P07349 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ifna5P07349 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ifna5P07349 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ifna5P07349 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ifna5P07349 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ifna5P07349 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ifna5P07349 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ifna5P07349 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ifna5P07349 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ifna5P07349 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ifna5P07349 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ifna5P07349 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ifna5P07349 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ifna5P07349 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ifna5P07349 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ifna5P07349 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ifna5P07349 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ifna5P07349 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ifna5P07349 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ifna5P07349 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ifna5P07349 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ifna5P07349 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ifna5P07349 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ifna5P07349 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ifna5P07349 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ifna5P07349 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ifna5P07349 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ifna5P07349 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ifna5P07349 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ifna5P07349 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ifna5P07349 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ifna5P07349 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ifna5P07349 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ifna5P07349 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ifna5P07349 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ifna5P07349 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Ifna5P07349 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ifna5P07349 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ifna5P07349 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ifna5P07349 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Ifna5P07349 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ifna5P07349 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ifna5P07349 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ifna5P07349 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ifna5P07349 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ifna5P07349 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ifna5P07349 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ifna5P07349 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ifna5P07349 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ifna5P07349 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ifna5P07349 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ifna5P07349 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ifna5P07349 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ifna5P07349 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ifna5P07349 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ifna5P07349 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ifna5P07349 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ifna5P07349 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ifna5P07349 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ifna5P07349 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ifna5P07349 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ifna5P07349 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ifna5P07349 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ifna5P07349 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ifna5P07349 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ifna5P07349 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ifna5P07349 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ifna5P07349 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ifna5P07349 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ifna5P07349 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ifna5P07349 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ifna5P07349 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ifna5P07349 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ifna5P07349 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ifna5P07349 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ifna5P07349 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ifna5P07349 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ifna5P07349 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ifna5P07349 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ifna5P07349 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ifna5P07349 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ifna5P07349 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ifna5P07349 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ifna5P07349 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ifna5P07349 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ifna5P07349 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ifna5P07349 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ifna5P07349 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ifna5P07349 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ifna5P07349 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ifna5P07349 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ifna5P07349 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ifna5P07349 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ifna5P07349 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ifna5P07349 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ifna5P07349 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ifna5P07349 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ifna5P07349 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ifna5P07349 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ifna5P07349 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms