Protein–RNA interactions for Protein: P01729

Ig lambda-2 chain V region MOPC 315, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01729 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16,55■□□□□ 0,24
P01729 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16,54■□□□□ 0,24
P01729 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16,54■□□□□ 0,24
P01729 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16,54■□□□□ 0,24
P01729 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,53■□□□□ 0,24
P01729 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16,53■□□□□ 0,24
P01729 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,53■□□□□ 0,24
P01729 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,53■□□□□ 0,24
P01729 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,53■□□□□ 0,24
P01729 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,53■□□□□ 0,24
P01729 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC16,52■□□□□ 0,24
P01729 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,52■□□□□ 0,24
P01729 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,52■□□□□ 0,23
P01729 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16,52■□□□□ 0,23
P01729 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16,52■□□□□ 0,23
P01729 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16,52■□□□□ 0,23
P01729 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,51■□□□□ 0,23
P01729 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC16,51■□□□□ 0,23
P01729 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16,51■□□□□ 0,23
P01729 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16,51■□□□□ 0,23
P01729 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16,51■□□□□ 0,23
P01729 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,49■□□□□ 0,23
P01729 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,49■□□□□ 0,23
P01729 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC16,49■□□□□ 0,23
P01729 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16,49■□□□□ 0,23
P01729 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,49■□□□□ 0,23
P01729 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16,49■□□□□ 0,23
P01729 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16,49■□□□□ 0,23
P01729 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16,49■□□□□ 0,23
P01729 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,49■□□□□ 0,23
P01729 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16,49■□□□□ 0,23
P01729 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC16,49■□□□□ 0,23
P01729 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC16,49■□□□□ 0,23
P01729 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,49■□□□□ 0,23
P01729 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC16,48■□□□□ 0,23
P01729 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16,48■□□□□ 0,23
P01729 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,48■□□□□ 0,23
P01729 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,48■□□□□ 0,23
P01729 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,47■□□□□ 0,23
P01729 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,47■□□□□ 0,23
P01729 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC16,47■□□□□ 0,23
P01729 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC16,47■□□□□ 0,23
P01729 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC16,47■□□□□ 0,23
P01729 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC16,47■□□□□ 0,23
P01729 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16,47■□□□□ 0,23
P01729 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16,47■□□□□ 0,23
P01729 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16,47■□□□□ 0,23
P01729 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC16,47■□□□□ 0,23
P01729 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC16,47■□□□□ 0,23
P01729 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,47■□□□□ 0,23
P01729 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16,47■□□□□ 0,23
P01729 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16,46■□□□□ 0,23
P01729 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16,46■□□□□ 0,23
P01729 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16,44■□□□□ 0,22
P01729 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16,44■□□□□ 0,22
P01729 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16,44■□□□□ 0,22
P01729 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC16,44■□□□□ 0,22
P01729 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC16,44■□□□□ 0,22
P01729 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,43■□□□□ 0,22
P01729 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,43■□□□□ 0,22
P01729 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,43■□□□□ 0,22
P01729 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,42■□□□□ 0,22
P01729 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC16,42■□□□□ 0,22
P01729 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16,42■□□□□ 0,22
P01729 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,4■□□□□ 0,22
P01729 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,4■□□□□ 0,22
P01729 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,4■□□□□ 0,22
P01729 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC16,39■□□□□ 0,21
P01729 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC16,39■□□□□ 0,21
P01729 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16,39■□□□□ 0,21
P01729 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,39■□□□□ 0,21
P01729 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16,39■□□□□ 0,21
P01729 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC16,38■□□□□ 0,21
P01729 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC16,38■□□□□ 0,21
P01729 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,38■□□□□ 0,21
P01729 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16,38■□□□□ 0,21
P01729 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,38■□□□□ 0,21
P01729 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16,37■□□□□ 0,21
P01729 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,37■□□□□ 0,21
P01729 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16,37■□□□□ 0,21
P01729 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16,37■□□□□ 0,21
P01729 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16,36■□□□□ 0,21
P01729 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16,36■□□□□ 0,21
P01729 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16,36■□□□□ 0,21
P01729 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,36■□□□□ 0,21
P01729 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16,35■□□□□ 0,21
P01729 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16,35■□□□□ 0,21
P01729 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC16,35■□□□□ 0,21
P01729 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC16,35■□□□□ 0,21
P01729 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16,35■□□□□ 0,21
P01729 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16,34■□□□□ 0,21
P01729 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC16,34■□□□□ 0,21
P01729 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16,34■□□□□ 0,21
P01729 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16,34■□□□□ 0,21
P01729 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16,34■□□□□ 0,21
P01729 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,34■□□□□ 0,21
P01729 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16,34■□□□□ 0,21
P01729 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,33■□□□□ 0,21
P01729 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16,33■□□□□ 0,21
P01729 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,33■□□□□ 0,21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,8 ms