Protein–RNA interactions for Protein: O88319

Ntsr1, Neurotensin receptor type 1, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ntsr1O88319 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ntsr1O88319 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ntsr1O88319 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ntsr1O88319 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ntsr1O88319 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ntsr1O88319 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ntsr1O88319 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ntsr1O88319 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ntsr1O88319 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ntsr1O88319 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ntsr1O88319 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ntsr1O88319 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ntsr1O88319 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ntsr1O88319 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ntsr1O88319 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ntsr1O88319 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ntsr1O88319 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ntsr1O88319 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ntsr1O88319 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ntsr1O88319 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ntsr1O88319 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ntsr1O88319 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ntsr1O88319 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ntsr1O88319 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ntsr1O88319 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ntsr1O88319 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ntsr1O88319 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ntsr1O88319 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ntsr1O88319 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ntsr1O88319 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ntsr1O88319 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ntsr1O88319 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ntsr1O88319 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ntsr1O88319 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ntsr1O88319 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ntsr1O88319 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ntsr1O88319 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ntsr1O88319 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ntsr1O88319 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ntsr1O88319 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ntsr1O88319 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ntsr1O88319 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ntsr1O88319 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ntsr1O88319 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ntsr1O88319 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ntsr1O88319 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ntsr1O88319 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ntsr1O88319 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ntsr1O88319 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ntsr1O88319 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ntsr1O88319 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ntsr1O88319 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ntsr1O88319 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ntsr1O88319 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ntsr1O88319 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ntsr1O88319 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ntsr1O88319 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ntsr1O88319 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ntsr1O88319 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ntsr1O88319 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ntsr1O88319 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ntsr1O88319 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ntsr1O88319 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Ntsr1O88319 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ntsr1O88319 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ntsr1O88319 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ntsr1O88319 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ntsr1O88319 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ntsr1O88319 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ntsr1O88319 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ntsr1O88319 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Ntsr1O88319 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Ntsr1O88319 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ntsr1O88319 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ntsr1O88319 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ntsr1O88319 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ntsr1O88319 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ntsr1O88319 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Ntsr1O88319 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ntsr1O88319 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ntsr1O88319 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ntsr1O88319 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ntsr1O88319 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ntsr1O88319 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ntsr1O88319 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ntsr1O88319 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ntsr1O88319 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ntsr1O88319 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ntsr1O88319 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ntsr1O88319 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ntsr1O88319 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ntsr1O88319 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ntsr1O88319 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ntsr1O88319 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ntsr1O88319 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ntsr1O88319 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ntsr1O88319 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Ntsr1O88319 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ntsr1O88319 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ntsr1O88319 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.6 ms