Protein–RNA interactions for Protein: O55208

Figla, Factor in the germline alpha, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FiglaO55208 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FiglaO55208 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FiglaO55208 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FiglaO55208 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FiglaO55208 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FiglaO55208 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FiglaO55208 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FiglaO55208 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FiglaO55208 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FiglaO55208 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FiglaO55208 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FiglaO55208 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
FiglaO55208 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FiglaO55208 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FiglaO55208 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FiglaO55208 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FiglaO55208 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FiglaO55208 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FiglaO55208 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FiglaO55208 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FiglaO55208 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FiglaO55208 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FiglaO55208 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FiglaO55208 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FiglaO55208 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FiglaO55208 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
FiglaO55208 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
FiglaO55208 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FiglaO55208 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
FiglaO55208 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
FiglaO55208 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
FiglaO55208 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
FiglaO55208 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FiglaO55208 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FiglaO55208 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FiglaO55208 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FiglaO55208 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
FiglaO55208 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
FiglaO55208 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FiglaO55208 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FiglaO55208 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FiglaO55208 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FiglaO55208 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
FiglaO55208 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
FiglaO55208 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
FiglaO55208 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
FiglaO55208 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
FiglaO55208 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
FiglaO55208 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
FiglaO55208 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
FiglaO55208 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
FiglaO55208 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
FiglaO55208 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
FiglaO55208 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
FiglaO55208 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
FiglaO55208 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
FiglaO55208 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
FiglaO55208 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
FiglaO55208 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
FiglaO55208 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
FiglaO55208 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
FiglaO55208 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
FiglaO55208 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
FiglaO55208 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
FiglaO55208 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
FiglaO55208 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
FiglaO55208 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
FiglaO55208 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
FiglaO55208 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
FiglaO55208 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
FiglaO55208 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
FiglaO55208 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
FiglaO55208 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
FiglaO55208 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
FiglaO55208 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
FiglaO55208 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
FiglaO55208 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
FiglaO55208 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
FiglaO55208 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
FiglaO55208 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
FiglaO55208 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
FiglaO55208 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
FiglaO55208 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
FiglaO55208 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
FiglaO55208 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
FiglaO55208 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
FiglaO55208 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
FiglaO55208 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
FiglaO55208 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
FiglaO55208 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
FiglaO55208 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
FiglaO55208 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
FiglaO55208 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
FiglaO55208 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
FiglaO55208 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
FiglaO55208 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
FiglaO55208 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
FiglaO55208 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
FiglaO55208 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
FiglaO55208 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.9 ms