Protein–RNA interactions for Protein: O35912

Emp3, Epithelial membrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Emp3O35912 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Emp3O35912 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Emp3O35912 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Emp3O35912 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Emp3O35912 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Emp3O35912 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Emp3O35912 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Emp3O35912 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Emp3O35912 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Emp3O35912 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Emp3O35912 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Emp3O35912 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Emp3O35912 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Emp3O35912 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Emp3O35912 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Emp3O35912 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Emp3O35912 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Emp3O35912 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Emp3O35912 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Emp3O35912 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Emp3O35912 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Emp3O35912 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Emp3O35912 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Emp3O35912 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Emp3O35912 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Emp3O35912 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Emp3O35912 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Emp3O35912 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Emp3O35912 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Emp3O35912 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Emp3O35912 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Emp3O35912 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Emp3O35912 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Emp3O35912 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Emp3O35912 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Emp3O35912 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Emp3O35912 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Emp3O35912 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Emp3O35912 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Emp3O35912 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Emp3O35912 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Emp3O35912 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Emp3O35912 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Emp3O35912 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Emp3O35912 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Emp3O35912 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Emp3O35912 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Emp3O35912 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Emp3O35912 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Emp3O35912 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Emp3O35912 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Emp3O35912 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Emp3O35912 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Emp3O35912 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Emp3O35912 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Emp3O35912 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Emp3O35912 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Emp3O35912 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Emp3O35912 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Emp3O35912 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Emp3O35912 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Emp3O35912 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Emp3O35912 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Emp3O35912 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Emp3O35912 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Emp3O35912 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Emp3O35912 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Emp3O35912 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Emp3O35912 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Emp3O35912 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Emp3O35912 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Emp3O35912 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Emp3O35912 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Emp3O35912 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Emp3O35912 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Emp3O35912 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Emp3O35912 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Emp3O35912 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Emp3O35912 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Emp3O35912 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Emp3O35912 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Emp3O35912 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Emp3O35912 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Emp3O35912 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Emp3O35912 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Emp3O35912 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Emp3O35912 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Emp3O35912 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Emp3O35912 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Emp3O35912 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Emp3O35912 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Emp3O35912 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Emp3O35912 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Emp3O35912 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Emp3O35912 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Emp3O35912 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Emp3O35912 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Emp3O35912 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Emp3O35912 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Emp3O35912 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 119.2 ms