Protein–RNA interactions for Protein: O35160

Pitx3, Pituitary homeobox 3, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx3O35160 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,03■□□□□ 0,64
Pitx3O35160 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC19,03■□□□□ 0,64
Pitx3O35160 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,03■□□□□ 0,64
Pitx3O35160 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC19,02■□□□□ 0,64
Pitx3O35160 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,02■□□□□ 0,64
Pitx3O35160 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19,02■□□□□ 0,64
Pitx3O35160 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,02■□□□□ 0,64
Pitx3O35160 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC19,01■□□□□ 0,63
Pitx3O35160 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,01■□□□□ 0,63
Pitx3O35160 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC19,01■□□□□ 0,63
Pitx3O35160 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0,63
Pitx3O35160 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0,63
Pitx3O35160 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0,63
Pitx3O35160 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0,63
Pitx3O35160 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18,99■□□□□ 0,63
Pitx3O35160 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,99■□□□□ 0,63
Pitx3O35160 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18,99■□□□□ 0,63
Pitx3O35160 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18,99■□□□□ 0,63
Pitx3O35160 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC18,98■□□□□ 0,63
Pitx3O35160 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18,98■□□□□ 0,63
Pitx3O35160 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC18,97■□□□□ 0,63
Pitx3O35160 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,97■□□□□ 0,63
Pitx3O35160 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,97■□□□□ 0,63
Pitx3O35160 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18,96■□□□□ 0,63
Pitx3O35160 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC18,96■□□□□ 0,63
Pitx3O35160 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,96■□□□□ 0,63
Pitx3O35160 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18,96■□□□□ 0,63
Pitx3O35160 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18,95■□□□□ 0,62
Pitx3O35160 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,95■□□□□ 0,62
Pitx3O35160 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC18,95■□□□□ 0,62
Pitx3O35160 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18,95■□□□□ 0,62
Pitx3O35160 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,95■□□□□ 0,62
Pitx3O35160 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18,95■□□□□ 0,62
Pitx3O35160 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,95■□□□□ 0,62
Pitx3O35160 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,94■□□□□ 0,62
Pitx3O35160 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18,94■□□□□ 0,62
Pitx3O35160 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18,94■□□□□ 0,62
Pitx3O35160 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC18,93■□□□□ 0,62
Pitx3O35160 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18,93■□□□□ 0,62
Pitx3O35160 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,93■□□□□ 0,62
Pitx3O35160 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,93■□□□□ 0,62
Pitx3O35160 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18,92■□□□□ 0,62
Pitx3O35160 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,92■□□□□ 0,62
Pitx3O35160 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18,92■□□□□ 0,62
Pitx3O35160 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18,92■□□□□ 0,62
Pitx3O35160 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,92■□□□□ 0,62
Pitx3O35160 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC18,91■□□□□ 0,62
Pitx3O35160 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18,91■□□□□ 0,62
Pitx3O35160 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC18,91■□□□□ 0,62
Pitx3O35160 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18,91■□□□□ 0,62
Pitx3O35160 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,91■□□□□ 0,62
Pitx3O35160 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,9■□□□□ 0,62
Pitx3O35160 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18,9■□□□□ 0,62
Pitx3O35160 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC18,9■□□□□ 0,62
Pitx3O35160 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,9■□□□□ 0,62
Pitx3O35160 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18,89■□□□□ 0,61
Pitx3O35160 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18,89■□□□□ 0,61
Pitx3O35160 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,89■□□□□ 0,61
Pitx3O35160 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,89■□□□□ 0,61
Pitx3O35160 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,88■□□□□ 0,61
Pitx3O35160 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18,88■□□□□ 0,61
Pitx3O35160 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18,88■□□□□ 0,61
Pitx3O35160 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18,88■□□□□ 0,61
Pitx3O35160 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC18,88■□□□□ 0,61
Pitx3O35160 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC18,88■□□□□ 0,61
Pitx3O35160 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC18,88■□□□□ 0,61
Pitx3O35160 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18,88■□□□□ 0,61
Pitx3O35160 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,87■□□□□ 0,61
Pitx3O35160 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18,87■□□□□ 0,61
Pitx3O35160 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,87■□□□□ 0,61
Pitx3O35160 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,87■□□□□ 0,61
Pitx3O35160 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18,87■□□□□ 0,61
Pitx3O35160 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC18,86■□□□□ 0,61
Pitx3O35160 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,86■□□□□ 0,61
Pitx3O35160 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18,86■□□□□ 0,61
Pitx3O35160 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC18,86■□□□□ 0,61
Pitx3O35160 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,86■□□□□ 0,61
Pitx3O35160 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,85■□□□□ 0,61
Pitx3O35160 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18,85■□□□□ 0,61
Pitx3O35160 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC18,85■□□□□ 0,61
Pitx3O35160 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,85■□□□□ 0,61
Pitx3O35160 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,84■□□□□ 0,61
Pitx3O35160 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,84■□□□□ 0,61
Pitx3O35160 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,84■□□□□ 0,61
Pitx3O35160 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC18,83■□□□□ 0,61
Pitx3O35160 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,83■□□□□ 0,61
Pitx3O35160 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,83■□□□□ 0,61
Pitx3O35160 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC18,83■□□□□ 0,6
Pitx3O35160 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18,82■□□□□ 0,6
Pitx3O35160 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18,82■□□□□ 0,6
Pitx3O35160 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC18,82■□□□□ 0,6
Pitx3O35160 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,82■□□□□ 0,6
Pitx3O35160 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,82■□□□□ 0,6
Pitx3O35160 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18,82■□□□□ 0,6
Pitx3O35160 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18,82■□□□□ 0,6
Pitx3O35160 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18,81■□□□□ 0,6
Pitx3O35160 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,81■□□□□ 0,6
Pitx3O35160 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,81■□□□□ 0,6
Pitx3O35160 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC18,81■□□□□ 0,6
Pitx3O35160 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC18,81■□□□□ 0,6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27,6 ms