Protein–RNA interactions for Protein: O09053

Wrn, Werner syndrome ATP-dependent helicase homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,401 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WrnO09053 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
WrnO09053 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
WrnO09053 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC36.92■■■■□ 3.5
WrnO09053 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
WrnO09053 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC36.92■■■■□ 3.5
WrnO09053 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
WrnO09053 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
WrnO09053 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
WrnO09053 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC36.9■■■■□ 3.5
WrnO09053 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
WrnO09053 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC36.9■■■■□ 3.5
WrnO09053 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
WrnO09053 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
WrnO09053 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC36.87■■■■□ 3.49
WrnO09053 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC36.87■■■■□ 3.49
WrnO09053 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
WrnO09053 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
WrnO09053 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.84■■■■□ 3.49
WrnO09053 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC36.84■■■■□ 3.49
WrnO09053 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
WrnO09053 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
WrnO09053 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
WrnO09053 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
WrnO09053 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
WrnO09053 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
WrnO09053 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
WrnO09053 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC36.8■■■■□ 3.48
WrnO09053 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC36.8■■■■□ 3.48
WrnO09053 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
WrnO09053 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC36.8■■■■□ 3.48
WrnO09053 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
WrnO09053 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
WrnO09053 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.79■■■■□ 3.48
WrnO09053 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC36.79■■■■□ 3.48
WrnO09053 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
WrnO09053 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.79■■■■□ 3.48
WrnO09053 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC36.77■■■■□ 3.48
WrnO09053 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
WrnO09053 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
WrnO09053 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC36.76■■■■□ 3.47
WrnO09053 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
WrnO09053 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
WrnO09053 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.75■■■■□ 3.47
WrnO09053 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC36.75■■■■□ 3.47
WrnO09053 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
WrnO09053 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
WrnO09053 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
WrnO09053 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
WrnO09053 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
WrnO09053 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC36.73■■■■□ 3.47
WrnO09053 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
WrnO09053 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
WrnO09053 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
WrnO09053 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.71■■■■□ 3.47
WrnO09053 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC36.69■■■■□ 3.46
WrnO09053 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC36.69■■■■□ 3.46
WrnO09053 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC36.68■■■■□ 3.46
WrnO09053 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
WrnO09053 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
WrnO09053 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
WrnO09053 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
WrnO09053 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC36.67■■■■□ 3.46
WrnO09053 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
WrnO09053 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
WrnO09053 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC36.66■■■■□ 3.46
WrnO09053 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
WrnO09053 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
WrnO09053 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.66■■■■□ 3.46
WrnO09053 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC36.65■■■■□ 3.46
WrnO09053 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
WrnO09053 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC36.65■■■■□ 3.46
WrnO09053 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC36.64■■■■□ 3.46
WrnO09053 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.64■■■■□ 3.46
WrnO09053 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
WrnO09053 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
WrnO09053 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC36.62■■■■□ 3.45
WrnO09053 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC36.62■■■■□ 3.45
WrnO09053 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
WrnO09053 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC36.61■■■■□ 3.45
WrnO09053 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
WrnO09053 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC36.59■■■■□ 3.45
WrnO09053 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC36.59■■■■□ 3.45
WrnO09053 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
WrnO09053 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC36.59■■■■□ 3.45
WrnO09053 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
WrnO09053 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
WrnO09053 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.45
WrnO09053 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.45
WrnO09053 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
WrnO09053 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.57■■■■□ 3.44
WrnO09053 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC36.56■■■■□ 3.44
WrnO09053 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.56■■■■□ 3.44
WrnO09053 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC36.55■■■■□ 3.44
WrnO09053 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
WrnO09053 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.54■■■■□ 3.44
WrnO09053 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
WrnO09053 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
WrnO09053 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC36.53■■■■□ 3.44
WrnO09053 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC36.51■■■■□ 3.44
WrnO09053 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms