Protein–RNA interactions for Protein: O08785

Clock, Circadian locomoter output cycles protein kaput, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClockO08785 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ClockO08785 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ClockO08785 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ClockO08785 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ClockO08785 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ClockO08785 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
ClockO08785 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ClockO08785 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ClockO08785 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ClockO08785 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ClockO08785 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ClockO08785 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ClockO08785 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ClockO08785 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ClockO08785 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ClockO08785 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ClockO08785 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ClockO08785 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ClockO08785 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ClockO08785 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ClockO08785 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ClockO08785 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ClockO08785 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ClockO08785 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ClockO08785 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ClockO08785 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ClockO08785 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ClockO08785 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ClockO08785 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ClockO08785 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ClockO08785 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ClockO08785 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ClockO08785 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ClockO08785 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ClockO08785 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ClockO08785 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ClockO08785 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ClockO08785 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ClockO08785 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ClockO08785 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ClockO08785 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ClockO08785 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ClockO08785 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ClockO08785 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ClockO08785 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ClockO08785 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ClockO08785 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ClockO08785 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ClockO08785 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ClockO08785 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ClockO08785 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ClockO08785 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ClockO08785 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ClockO08785 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ClockO08785 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ClockO08785 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ClockO08785 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ClockO08785 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ClockO08785 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ClockO08785 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ClockO08785 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ClockO08785 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ClockO08785 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ClockO08785 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ClockO08785 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ClockO08785 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ClockO08785 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ClockO08785 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ClockO08785 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ClockO08785 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ClockO08785 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ClockO08785 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ClockO08785 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ClockO08785 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ClockO08785 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ClockO08785 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ClockO08785 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ClockO08785 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ClockO08785 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ClockO08785 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ClockO08785 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ClockO08785 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ClockO08785 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ClockO08785 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ClockO08785 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ClockO08785 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ClockO08785 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ClockO08785 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ClockO08785 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ClockO08785 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ClockO08785 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ClockO08785 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ClockO08785 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ClockO08785 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ClockO08785 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ClockO08785 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ClockO08785 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ClockO08785 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ClockO08785 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ClockO08785 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms