Protein–RNA interactions for Protein: O08688

Capn5, Calpain-5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn5O08688 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Capn5O08688 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Capn5O08688 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Capn5O08688 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Capn5O08688 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Capn5O08688 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Capn5O08688 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Capn5O08688 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Capn5O08688 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Capn5O08688 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Capn5O08688 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Capn5O08688 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Capn5O08688 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Capn5O08688 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Capn5O08688 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Capn5O08688 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Capn5O08688 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Capn5O08688 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Capn5O08688 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Capn5O08688 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Capn5O08688 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Capn5O08688 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Capn5O08688 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Capn5O08688 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Capn5O08688 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Capn5O08688 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Capn5O08688 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Capn5O08688 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Capn5O08688 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Capn5O08688 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Capn5O08688 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Capn5O08688 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Capn5O08688 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Capn5O08688 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Capn5O08688 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Capn5O08688 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Capn5O08688 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Capn5O08688 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Capn5O08688 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Capn5O08688 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Capn5O08688 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Capn5O08688 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Capn5O08688 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Capn5O08688 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Capn5O08688 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Capn5O08688 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Capn5O08688 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Capn5O08688 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Capn5O08688 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Capn5O08688 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Capn5O08688 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Capn5O08688 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Capn5O08688 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Capn5O08688 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Capn5O08688 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Capn5O08688 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Capn5O08688 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Capn5O08688 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Capn5O08688 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Capn5O08688 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Capn5O08688 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Capn5O08688 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Capn5O08688 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Capn5O08688 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Capn5O08688 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Capn5O08688 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Capn5O08688 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Capn5O08688 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Capn5O08688 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Capn5O08688 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Capn5O08688 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Capn5O08688 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Capn5O08688 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Capn5O08688 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Capn5O08688 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Capn5O08688 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Capn5O08688 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Capn5O08688 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Capn5O08688 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Capn5O08688 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Capn5O08688 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Capn5O08688 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Capn5O08688 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Capn5O08688 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Capn5O08688 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Capn5O08688 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Capn5O08688 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Capn5O08688 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Capn5O08688 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Capn5O08688 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Capn5O08688 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Capn5O08688 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Capn5O08688 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Capn5O08688 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Capn5O08688 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Capn5O08688 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Capn5O08688 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Capn5O08688 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Capn5O08688 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Capn5O08688 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms