Protein–RNA interactions for Protein: O08665

Sema3a, Semaphorin-3A, mousemouse

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3aO08665 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sema3aO08665 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sema3aO08665 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Sema3aO08665 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sema3aO08665 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Sema3aO08665 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Sema3aO08665 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sema3aO08665 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sema3aO08665 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Sema3aO08665 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sema3aO08665 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sema3aO08665 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sema3aO08665 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sema3aO08665 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sema3aO08665 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sema3aO08665 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sema3aO08665 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sema3aO08665 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sema3aO08665 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sema3aO08665 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sema3aO08665 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sema3aO08665 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sema3aO08665 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sema3aO08665 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sema3aO08665 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sema3aO08665 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sema3aO08665 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Sema3aO08665 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sema3aO08665 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sema3aO08665 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sema3aO08665 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sema3aO08665 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sema3aO08665 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Sema3aO08665 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sema3aO08665 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sema3aO08665 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sema3aO08665 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Sema3aO08665 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sema3aO08665 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sema3aO08665 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sema3aO08665 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sema3aO08665 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sema3aO08665 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sema3aO08665 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sema3aO08665 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sema3aO08665 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sema3aO08665 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sema3aO08665 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sema3aO08665 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sema3aO08665 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sema3aO08665 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sema3aO08665 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sema3aO08665 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Sema3aO08665 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sema3aO08665 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sema3aO08665 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sema3aO08665 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sema3aO08665 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sema3aO08665 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sema3aO08665 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sema3aO08665 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sema3aO08665 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sema3aO08665 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sema3aO08665 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sema3aO08665 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sema3aO08665 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sema3aO08665 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sema3aO08665 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sema3aO08665 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sema3aO08665 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sema3aO08665 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sema3aO08665 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sema3aO08665 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sema3aO08665 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sema3aO08665 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sema3aO08665 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sema3aO08665 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sema3aO08665 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Sema3aO08665 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Sema3aO08665 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Sema3aO08665 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
Sema3aO08665 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sema3aO08665 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sema3aO08665 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sema3aO08665 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sema3aO08665 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sema3aO08665 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sema3aO08665 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sema3aO08665 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sema3aO08665 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sema3aO08665 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sema3aO08665 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sema3aO08665 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sema3aO08665 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sema3aO08665 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sema3aO08665 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sema3aO08665 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sema3aO08665 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sema3aO08665 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Sema3aO08665 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms