Protein–RNA interactions for Protein: K9J7G2

Gm8653, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8653K9J7G2 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm8653K9J7G2 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm8653K9J7G2 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm8653K9J7G2 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm8653K9J7G2 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm8653K9J7G2 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm8653K9J7G2 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm8653K9J7G2 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm8653K9J7G2 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm8653K9J7G2 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm8653K9J7G2 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm8653K9J7G2 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm8653K9J7G2 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm8653K9J7G2 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm8653K9J7G2 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm8653K9J7G2 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm8653K9J7G2 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gm8653K9J7G2 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Gm8653K9J7G2 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm8653K9J7G2 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm8653K9J7G2 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm8653K9J7G2 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm8653K9J7G2 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm8653K9J7G2 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm8653K9J7G2 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm8653K9J7G2 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm8653K9J7G2 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm8653K9J7G2 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm8653K9J7G2 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm8653K9J7G2 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm8653K9J7G2 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm8653K9J7G2 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm8653K9J7G2 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm8653K9J7G2 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm8653K9J7G2 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm8653K9J7G2 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm8653K9J7G2 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm8653K9J7G2 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm8653K9J7G2 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm8653K9J7G2 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm8653K9J7G2 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm8653K9J7G2 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm8653K9J7G2 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm8653K9J7G2 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm8653K9J7G2 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm8653K9J7G2 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm8653K9J7G2 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm8653K9J7G2 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm8653K9J7G2 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm8653K9J7G2 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm8653K9J7G2 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Gm8653K9J7G2 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm8653K9J7G2 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm8653K9J7G2 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm8653K9J7G2 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm8653K9J7G2 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm8653K9J7G2 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm8653K9J7G2 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm8653K9J7G2 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm8653K9J7G2 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm8653K9J7G2 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm8653K9J7G2 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm8653K9J7G2 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm8653K9J7G2 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm8653K9J7G2 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm8653K9J7G2 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm8653K9J7G2 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm8653K9J7G2 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm8653K9J7G2 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm8653K9J7G2 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm8653K9J7G2 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm8653K9J7G2 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm8653K9J7G2 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm8653K9J7G2 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Gm8653K9J7G2 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Gm8653K9J7G2 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Gm8653K9J7G2 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Gm8653K9J7G2 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Gm8653K9J7G2 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Gm8653K9J7G2 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm8653K9J7G2 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm8653K9J7G2 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm8653K9J7G2 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm8653K9J7G2 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm8653K9J7G2 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm8653K9J7G2 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm8653K9J7G2 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm8653K9J7G2 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm8653K9J7G2 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm8653K9J7G2 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm8653K9J7G2 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm8653K9J7G2 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm8653K9J7G2 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm8653K9J7G2 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm8653K9J7G2 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm8653K9J7G2 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm8653K9J7G2 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm8653K9J7G2 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm8653K9J7G2 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm8653K9J7G2 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms