Protein–RNA interactions for Protein: J3QP87

Gm2035, Predicted pseudogene 2035, mousemouse

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Length 144 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2035J3QP87 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gm2035J3QP87 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gm2035J3QP87 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gm2035J3QP87 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gm2035J3QP87 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gm2035J3QP87 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gm2035J3QP87 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gm2035J3QP87 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gm2035J3QP87 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gm2035J3QP87 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gm2035J3QP87 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gm2035J3QP87 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Gm2035J3QP87 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gm2035J3QP87 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gm2035J3QP87 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gm2035J3QP87 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gm2035J3QP87 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gm2035J3QP87 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gm2035J3QP87 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Gm2035J3QP87 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gm2035J3QP87 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gm2035J3QP87 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gm2035J3QP87 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gm2035J3QP87 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gm2035J3QP87 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gm2035J3QP87 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gm2035J3QP87 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gm2035J3QP87 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gm2035J3QP87 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gm2035J3QP87 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gm2035J3QP87 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gm2035J3QP87 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gm2035J3QP87 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gm2035J3QP87 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gm2035J3QP87 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gm2035J3QP87 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gm2035J3QP87 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gm2035J3QP87 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gm2035J3QP87 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gm2035J3QP87 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gm2035J3QP87 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gm2035J3QP87 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gm2035J3QP87 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gm2035J3QP87 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gm2035J3QP87 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gm2035J3QP87 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gm2035J3QP87 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gm2035J3QP87 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gm2035J3QP87 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gm2035J3QP87 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Gm2035J3QP87 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gm2035J3QP87 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gm2035J3QP87 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gm2035J3QP87 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gm2035J3QP87 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gm2035J3QP87 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gm2035J3QP87 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gm2035J3QP87 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gm2035J3QP87 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Gm2035J3QP87 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gm2035J3QP87 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gm2035J3QP87 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gm2035J3QP87 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gm2035J3QP87 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Gm2035J3QP87 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gm2035J3QP87 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gm2035J3QP87 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gm2035J3QP87 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Gm2035J3QP87 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gm2035J3QP87 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gm2035J3QP87 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gm2035J3QP87 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gm2035J3QP87 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gm2035J3QP87 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gm2035J3QP87 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gm2035J3QP87 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gm2035J3QP87 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gm2035J3QP87 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gm2035J3QP87 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Gm2035J3QP87 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Gm2035J3QP87 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gm2035J3QP87 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gm2035J3QP87 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gm2035J3QP87 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gm2035J3QP87 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gm2035J3QP87 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gm2035J3QP87 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Gm2035J3QP87 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Gm2035J3QP87 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gm2035J3QP87 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gm2035J3QP87 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gm2035J3QP87 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gm2035J3QP87 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gm2035J3QP87 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Gm2035J3QP87 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Gm2035J3QP87 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gm2035J3QP87 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gm2035J3QP87 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gm2035J3QP87 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gm2035J3QP87 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
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