Protein–RNA interactions for Protein: F6QL70

Gm17669, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17669F6QL70 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm17669F6QL70 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm17669F6QL70 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm17669F6QL70 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm17669F6QL70 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm17669F6QL70 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm17669F6QL70 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm17669F6QL70 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm17669F6QL70 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm17669F6QL70 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm17669F6QL70 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm17669F6QL70 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm17669F6QL70 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm17669F6QL70 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm17669F6QL70 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm17669F6QL70 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm17669F6QL70 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Gm17669F6QL70 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Gm17669F6QL70 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm17669F6QL70 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm17669F6QL70 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm17669F6QL70 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm17669F6QL70 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm17669F6QL70 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm17669F6QL70 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm17669F6QL70 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm17669F6QL70 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm17669F6QL70 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm17669F6QL70 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm17669F6QL70 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm17669F6QL70 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm17669F6QL70 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm17669F6QL70 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm17669F6QL70 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm17669F6QL70 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm17669F6QL70 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm17669F6QL70 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm17669F6QL70 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm17669F6QL70 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm17669F6QL70 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm17669F6QL70 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm17669F6QL70 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm17669F6QL70 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm17669F6QL70 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm17669F6QL70 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm17669F6QL70 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm17669F6QL70 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm17669F6QL70 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm17669F6QL70 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm17669F6QL70 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm17669F6QL70 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm17669F6QL70 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm17669F6QL70 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm17669F6QL70 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm17669F6QL70 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm17669F6QL70 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm17669F6QL70 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm17669F6QL70 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm17669F6QL70 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm17669F6QL70 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm17669F6QL70 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm17669F6QL70 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm17669F6QL70 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm17669F6QL70 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm17669F6QL70 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm17669F6QL70 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm17669F6QL70 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm17669F6QL70 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm17669F6QL70 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm17669F6QL70 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm17669F6QL70 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm17669F6QL70 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm17669F6QL70 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm17669F6QL70 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm17669F6QL70 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm17669F6QL70 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm17669F6QL70 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm17669F6QL70 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm17669F6QL70 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm17669F6QL70 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm17669F6QL70 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm17669F6QL70 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm17669F6QL70 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm17669F6QL70 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm17669F6QL70 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm17669F6QL70 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm17669F6QL70 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm17669F6QL70 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm17669F6QL70 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm17669F6QL70 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm17669F6QL70 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm17669F6QL70 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm17669F6QL70 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm17669F6QL70 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm17669F6QL70 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm17669F6QL70 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm17669F6QL70 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm17669F6QL70 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm17669F6QL70 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm17669F6QL70 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.1 ms